Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS9Q8WXC6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS9Q8WXC6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS9Q8WXC6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS9Q8WXC6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS9Q8WXC6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS9Q8WXC6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS9Q8WXC6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPS9Q8WXC6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
COPS9Q8WXC6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPS9Q8WXC6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
COPS9Q8WXC6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPS9Q8WXC6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPS9Q8WXC6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPS9Q8WXC6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPS9Q8WXC6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPS9Q8WXC6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPS9Q8WXC6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPS9Q8WXC6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPS9Q8WXC6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPS9Q8WXC6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPS9Q8WXC6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPS9Q8WXC6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPS9Q8WXC6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPS9Q8WXC6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPS9Q8WXC6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPS9Q8WXC6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPS9Q8WXC6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPS9Q8WXC6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPS9Q8WXC6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS9Q8WXC6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS9Q8WXC6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS9Q8WXC6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS9Q8WXC6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS9Q8WXC6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS9Q8WXC6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COPS9Q8WXC6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COPS9Q8WXC6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COPS9Q8WXC6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COPS9Q8WXC6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COPS9Q8WXC6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
COPS9Q8WXC6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
COPS9Q8WXC6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
COPS9Q8WXC6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPS9Q8WXC6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPS9Q8WXC6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPS9Q8WXC6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPS9Q8WXC6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPS9Q8WXC6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPS9Q8WXC6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPS9Q8WXC6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPS9Q8WXC6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPS9Q8WXC6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COPS9Q8WXC6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COPS9Q8WXC6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPS9Q8WXC6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPS9Q8WXC6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPS9Q8WXC6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPS9Q8WXC6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPS9Q8WXC6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPS9Q8WXC6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPS9Q8WXC6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPS9Q8WXC6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPS9Q8WXC6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS9Q8WXC6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS9Q8WXC6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS9Q8WXC6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS9Q8WXC6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS9Q8WXC6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS9Q8WXC6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS9Q8WXC6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS9Q8WXC6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS9Q8WXC6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS9Q8WXC6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS9Q8WXC6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS9Q8WXC6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS9Q8WXC6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS9Q8WXC6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS9Q8WXC6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS9Q8WXC6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS9Q8WXC6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS9Q8WXC6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS9Q8WXC6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS9Q8WXC6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS9Q8WXC6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS9Q8WXC6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS9Q8WXC6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS9Q8WXC6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS9Q8WXC6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS9Q8WXC6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS9Q8WXC6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS9Q8WXC6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS9Q8WXC6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS9Q8WXC6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS9Q8WXC6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS9Q8WXC6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS9Q8WXC6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS9Q8WXC6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS9Q8WXC6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS9Q8WXC6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms