Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SNX29Q8TEQ0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SNX29Q8TEQ0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SNX29Q8TEQ0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SNX29Q8TEQ0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SNX29Q8TEQ0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SNX29Q8TEQ0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SNX29Q8TEQ0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SNX29Q8TEQ0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SNX29Q8TEQ0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SNX29Q8TEQ0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SNX29Q8TEQ0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SNX29Q8TEQ0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SNX29Q8TEQ0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SNX29Q8TEQ0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SNX29Q8TEQ0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SNX29Q8TEQ0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SNX29Q8TEQ0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SNX29Q8TEQ0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SNX29Q8TEQ0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SNX29Q8TEQ0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SNX29Q8TEQ0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SNX29Q8TEQ0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SNX29Q8TEQ0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SNX29Q8TEQ0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SNX29Q8TEQ0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SNX29Q8TEQ0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SNX29Q8TEQ0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SNX29Q8TEQ0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SNX29Q8TEQ0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SNX29Q8TEQ0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SNX29Q8TEQ0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SNX29Q8TEQ0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
SNX29Q8TEQ0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SNX29Q8TEQ0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SNX29Q8TEQ0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SNX29Q8TEQ0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SNX29Q8TEQ0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SNX29Q8TEQ0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SNX29Q8TEQ0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SNX29Q8TEQ0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SNX29Q8TEQ0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SNX29Q8TEQ0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SNX29Q8TEQ0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SNX29Q8TEQ0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SNX29Q8TEQ0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SNX29Q8TEQ0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SNX29Q8TEQ0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SNX29Q8TEQ0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SNX29Q8TEQ0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SNX29Q8TEQ0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SNX29Q8TEQ0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SNX29Q8TEQ0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SNX29Q8TEQ0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SNX29Q8TEQ0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SNX29Q8TEQ0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SNX29Q8TEQ0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SNX29Q8TEQ0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SNX29Q8TEQ0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SNX29Q8TEQ0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SNX29Q8TEQ0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SNX29Q8TEQ0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SNX29Q8TEQ0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SNX29Q8TEQ0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SNX29Q8TEQ0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SNX29Q8TEQ0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SNX29Q8TEQ0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SNX29Q8TEQ0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SNX29Q8TEQ0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SNX29Q8TEQ0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SNX29Q8TEQ0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SNX29Q8TEQ0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SNX29Q8TEQ0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SNX29Q8TEQ0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SNX29Q8TEQ0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SNX29Q8TEQ0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SNX29Q8TEQ0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SNX29Q8TEQ0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SNX29Q8TEQ0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SNX29Q8TEQ0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SNX29Q8TEQ0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SNX29Q8TEQ0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SNX29Q8TEQ0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SNX29Q8TEQ0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SNX29Q8TEQ0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SNX29Q8TEQ0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SNX29Q8TEQ0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SNX29Q8TEQ0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SNX29Q8TEQ0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SNX29Q8TEQ0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SNX29Q8TEQ0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SNX29Q8TEQ0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SNX29Q8TEQ0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SNX29Q8TEQ0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SNX29Q8TEQ0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SNX29Q8TEQ0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SNX29Q8TEQ0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SNX29Q8TEQ0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SNX29Q8TEQ0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SNX29Q8TEQ0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms