Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE85

GRHL3, Grainyhead-like protein 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRHL3Q8TE85 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRHL3Q8TE85 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GRHL3Q8TE85 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRHL3Q8TE85 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRHL3Q8TE85 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRHL3Q8TE85 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRHL3Q8TE85 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRHL3Q8TE85 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRHL3Q8TE85 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRHL3Q8TE85 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRHL3Q8TE85 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRHL3Q8TE85 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRHL3Q8TE85 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRHL3Q8TE85 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRHL3Q8TE85 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRHL3Q8TE85 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRHL3Q8TE85 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRHL3Q8TE85 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRHL3Q8TE85 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRHL3Q8TE85 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRHL3Q8TE85 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRHL3Q8TE85 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRHL3Q8TE85 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRHL3Q8TE85 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRHL3Q8TE85 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRHL3Q8TE85 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRHL3Q8TE85 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRHL3Q8TE85 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GRHL3Q8TE85 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GRHL3Q8TE85 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRHL3Q8TE85 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRHL3Q8TE85 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRHL3Q8TE85 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GRHL3Q8TE85 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRHL3Q8TE85 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GRHL3Q8TE85 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GRHL3Q8TE85 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GRHL3Q8TE85 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GRHL3Q8TE85 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GRHL3Q8TE85 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GRHL3Q8TE85 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GRHL3Q8TE85 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GRHL3Q8TE85 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GRHL3Q8TE85 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRHL3Q8TE85 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRHL3Q8TE85 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRHL3Q8TE85 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRHL3Q8TE85 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRHL3Q8TE85 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRHL3Q8TE85 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GRHL3Q8TE85 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRHL3Q8TE85 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRHL3Q8TE85 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRHL3Q8TE85 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRHL3Q8TE85 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRHL3Q8TE85 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRHL3Q8TE85 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRHL3Q8TE85 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRHL3Q8TE85 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRHL3Q8TE85 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRHL3Q8TE85 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRHL3Q8TE85 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRHL3Q8TE85 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRHL3Q8TE85 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRHL3Q8TE85 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRHL3Q8TE85 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRHL3Q8TE85 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRHL3Q8TE85 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRHL3Q8TE85 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRHL3Q8TE85 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRHL3Q8TE85 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRHL3Q8TE85 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRHL3Q8TE85 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRHL3Q8TE85 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRHL3Q8TE85 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GRHL3Q8TE85 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GRHL3Q8TE85 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRHL3Q8TE85 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRHL3Q8TE85 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GRHL3Q8TE85 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRHL3Q8TE85 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRHL3Q8TE85 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GRHL3Q8TE85 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRHL3Q8TE85 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRHL3Q8TE85 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRHL3Q8TE85 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRHL3Q8TE85 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRHL3Q8TE85 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRHL3Q8TE85 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRHL3Q8TE85 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRHL3Q8TE85 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRHL3Q8TE85 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRHL3Q8TE85 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRHL3Q8TE85 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRHL3Q8TE85 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRHL3Q8TE85 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRHL3Q8TE85 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRHL3Q8TE85 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRHL3Q8TE85 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GRHL3Q8TE85 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms