Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE22

SETD9, SET domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD9Q8NE22 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SETD9Q8NE22 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SETD9Q8NE22 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETD9Q8NE22 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SETD9Q8NE22 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SETD9Q8NE22 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SETD9Q8NE22 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SETD9Q8NE22 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SETD9Q8NE22 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SETD9Q8NE22 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SETD9Q8NE22 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SETD9Q8NE22 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD9Q8NE22 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD9Q8NE22 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD9Q8NE22 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD9Q8NE22 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD9Q8NE22 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD9Q8NE22 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETD9Q8NE22 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SETD9Q8NE22 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETD9Q8NE22 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETD9Q8NE22 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SETD9Q8NE22 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SETD9Q8NE22 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SETD9Q8NE22 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SETD9Q8NE22 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SETD9Q8NE22 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SETD9Q8NE22 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SETD9Q8NE22 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SETD9Q8NE22 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SETD9Q8NE22 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SETD9Q8NE22 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SETD9Q8NE22 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SETD9Q8NE22 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SETD9Q8NE22 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SETD9Q8NE22 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SETD9Q8NE22 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SETD9Q8NE22 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SETD9Q8NE22 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SETD9Q8NE22 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SETD9Q8NE22 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SETD9Q8NE22 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SETD9Q8NE22 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SETD9Q8NE22 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD9Q8NE22 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD9Q8NE22 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD9Q8NE22 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SETD9Q8NE22 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SETD9Q8NE22 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SETD9Q8NE22 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SETD9Q8NE22 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SETD9Q8NE22 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD9Q8NE22 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD9Q8NE22 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD9Q8NE22 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD9Q8NE22 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD9Q8NE22 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD9Q8NE22 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD9Q8NE22 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD9Q8NE22 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SETD9Q8NE22 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SETD9Q8NE22 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SETD9Q8NE22 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SETD9Q8NE22 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SETD9Q8NE22 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SETD9Q8NE22 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SETD9Q8NE22 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SETD9Q8NE22 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SETD9Q8NE22 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD9Q8NE22 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD9Q8NE22 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD9Q8NE22 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD9Q8NE22 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD9Q8NE22 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD9Q8NE22 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETD9Q8NE22 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SETD9Q8NE22 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SETD9Q8NE22 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SETD9Q8NE22 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SETD9Q8NE22 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SETD9Q8NE22 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SETD9Q8NE22 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SETD9Q8NE22 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SETD9Q8NE22 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SETD9Q8NE22 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SETD9Q8NE22 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SETD9Q8NE22 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SETD9Q8NE22 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD9Q8NE22 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD9Q8NE22 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD9Q8NE22 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SETD9Q8NE22 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SETD9Q8NE22 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SETD9Q8NE22 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SETD9Q8NE22 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SETD9Q8NE22 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SETD9Q8NE22 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SETD9Q8NE22 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SETD9Q8NE22 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SETD9Q8NE22 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms