Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3A8

PARP8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP8Q8N3A8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PARP8Q8N3A8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PARP8Q8N3A8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARP8Q8N3A8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARP8Q8N3A8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PARP8Q8N3A8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PARP8Q8N3A8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PARP8Q8N3A8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PARP8Q8N3A8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PARP8Q8N3A8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARP8Q8N3A8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARP8Q8N3A8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARP8Q8N3A8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARP8Q8N3A8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARP8Q8N3A8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARP8Q8N3A8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARP8Q8N3A8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARP8Q8N3A8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARP8Q8N3A8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARP8Q8N3A8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARP8Q8N3A8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARP8Q8N3A8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARP8Q8N3A8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP8Q8N3A8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP8Q8N3A8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP8Q8N3A8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARP8Q8N3A8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARP8Q8N3A8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARP8Q8N3A8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP8Q8N3A8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP8Q8N3A8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP8Q8N3A8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP8Q8N3A8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP8Q8N3A8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARP8Q8N3A8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARP8Q8N3A8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARP8Q8N3A8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARP8Q8N3A8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARP8Q8N3A8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARP8Q8N3A8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARP8Q8N3A8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARP8Q8N3A8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARP8Q8N3A8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARP8Q8N3A8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARP8Q8N3A8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARP8Q8N3A8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARP8Q8N3A8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PARP8Q8N3A8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARP8Q8N3A8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARP8Q8N3A8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARP8Q8N3A8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARP8Q8N3A8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARP8Q8N3A8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARP8Q8N3A8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARP8Q8N3A8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARP8Q8N3A8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PARP8Q8N3A8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PARP8Q8N3A8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PARP8Q8N3A8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PARP8Q8N3A8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PARP8Q8N3A8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP8Q8N3A8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP8Q8N3A8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP8Q8N3A8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP8Q8N3A8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP8Q8N3A8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP8Q8N3A8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARP8Q8N3A8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARP8Q8N3A8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARP8Q8N3A8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARP8Q8N3A8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARP8Q8N3A8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARP8Q8N3A8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARP8Q8N3A8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARP8Q8N3A8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARP8Q8N3A8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARP8Q8N3A8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PARP8Q8N3A8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP8Q8N3A8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP8Q8N3A8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP8Q8N3A8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP8Q8N3A8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP8Q8N3A8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP8Q8N3A8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP8Q8N3A8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP8Q8N3A8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP8Q8N3A8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP8Q8N3A8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP8Q8N3A8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PARP8Q8N3A8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PARP8Q8N3A8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PARP8Q8N3A8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PARP8Q8N3A8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PARP8Q8N3A8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PARP8Q8N3A8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PARP8Q8N3A8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PARP8Q8N3A8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PARP8Q8N3A8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PARP8Q8N3A8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PARP8Q8N3A8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms