Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMNTD2Q8IXW0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMNTD2Q8IXW0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMNTD2Q8IXW0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMNTD2Q8IXW0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMNTD2Q8IXW0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMNTD2Q8IXW0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMNTD2Q8IXW0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMNTD2Q8IXW0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMNTD2Q8IXW0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMNTD2Q8IXW0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMNTD2Q8IXW0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMNTD2Q8IXW0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LMNTD2Q8IXW0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
LMNTD2Q8IXW0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMNTD2Q8IXW0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMNTD2Q8IXW0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMNTD2Q8IXW0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMNTD2Q8IXW0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMNTD2Q8IXW0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMNTD2Q8IXW0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMNTD2Q8IXW0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMNTD2Q8IXW0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMNTD2Q8IXW0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMNTD2Q8IXW0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LMNTD2Q8IXW0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMNTD2Q8IXW0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMNTD2Q8IXW0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LMNTD2Q8IXW0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LMNTD2Q8IXW0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMNTD2Q8IXW0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMNTD2Q8IXW0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMNTD2Q8IXW0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMNTD2Q8IXW0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMNTD2Q8IXW0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMNTD2Q8IXW0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMNTD2Q8IXW0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMNTD2Q8IXW0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMNTD2Q8IXW0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMNTD2Q8IXW0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMNTD2Q8IXW0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMNTD2Q8IXW0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMNTD2Q8IXW0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMNTD2Q8IXW0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMNTD2Q8IXW0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMNTD2Q8IXW0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LMNTD2Q8IXW0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMNTD2Q8IXW0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMNTD2Q8IXW0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMNTD2Q8IXW0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMNTD2Q8IXW0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMNTD2Q8IXW0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMNTD2Q8IXW0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMNTD2Q8IXW0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMNTD2Q8IXW0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMNTD2Q8IXW0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMNTD2Q8IXW0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMNTD2Q8IXW0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMNTD2Q8IXW0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMNTD2Q8IXW0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMNTD2Q8IXW0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMNTD2Q8IXW0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMNTD2Q8IXW0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMNTD2Q8IXW0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMNTD2Q8IXW0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMNTD2Q8IXW0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMNTD2Q8IXW0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMNTD2Q8IXW0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMNTD2Q8IXW0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMNTD2Q8IXW0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMNTD2Q8IXW0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMNTD2Q8IXW0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LMNTD2Q8IXW0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMNTD2Q8IXW0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMNTD2Q8IXW0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMNTD2Q8IXW0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMNTD2Q8IXW0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMNTD2Q8IXW0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMNTD2Q8IXW0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMNTD2Q8IXW0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMNTD2Q8IXW0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMNTD2Q8IXW0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMNTD2Q8IXW0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMNTD2Q8IXW0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMNTD2Q8IXW0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMNTD2Q8IXW0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMNTD2Q8IXW0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMNTD2Q8IXW0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMNTD2Q8IXW0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMNTD2Q8IXW0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMNTD2Q8IXW0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
LMNTD2Q8IXW0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMNTD2Q8IXW0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMNTD2Q8IXW0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMNTD2Q8IXW0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMNTD2Q8IXW0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMNTD2Q8IXW0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMNTD2Q8IXW0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMNTD2Q8IXW0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMNTD2Q8IXW0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms