Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXN7

RIMKLA, N-acetylaspartylglutamate synthase A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLAQ8IXN7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIMKLAQ8IXN7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIMKLAQ8IXN7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIMKLAQ8IXN7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIMKLAQ8IXN7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIMKLAQ8IXN7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIMKLAQ8IXN7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIMKLAQ8IXN7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIMKLAQ8IXN7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RIMKLAQ8IXN7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIMKLAQ8IXN7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIMKLAQ8IXN7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RIMKLAQ8IXN7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIMKLAQ8IXN7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIMKLAQ8IXN7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIMKLAQ8IXN7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIMKLAQ8IXN7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIMKLAQ8IXN7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIMKLAQ8IXN7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIMKLAQ8IXN7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIMKLAQ8IXN7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIMKLAQ8IXN7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIMKLAQ8IXN7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIMKLAQ8IXN7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIMKLAQ8IXN7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIMKLAQ8IXN7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIMKLAQ8IXN7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIMKLAQ8IXN7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIMKLAQ8IXN7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIMKLAQ8IXN7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIMKLAQ8IXN7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIMKLAQ8IXN7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIMKLAQ8IXN7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIMKLAQ8IXN7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RIMKLAQ8IXN7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIMKLAQ8IXN7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RIMKLAQ8IXN7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RIMKLAQ8IXN7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RIMKLAQ8IXN7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RIMKLAQ8IXN7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RIMKLAQ8IXN7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIMKLAQ8IXN7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIMKLAQ8IXN7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIMKLAQ8IXN7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIMKLAQ8IXN7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIMKLAQ8IXN7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RIMKLAQ8IXN7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIMKLAQ8IXN7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIMKLAQ8IXN7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RIMKLAQ8IXN7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIMKLAQ8IXN7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIMKLAQ8IXN7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIMKLAQ8IXN7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIMKLAQ8IXN7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIMKLAQ8IXN7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIMKLAQ8IXN7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIMKLAQ8IXN7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIMKLAQ8IXN7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIMKLAQ8IXN7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIMKLAQ8IXN7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIMKLAQ8IXN7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RIMKLAQ8IXN7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RIMKLAQ8IXN7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RIMKLAQ8IXN7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIMKLAQ8IXN7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIMKLAQ8IXN7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIMKLAQ8IXN7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIMKLAQ8IXN7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIMKLAQ8IXN7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIMKLAQ8IXN7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIMKLAQ8IXN7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RIMKLAQ8IXN7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIMKLAQ8IXN7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIMKLAQ8IXN7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIMKLAQ8IXN7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIMKLAQ8IXN7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIMKLAQ8IXN7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIMKLAQ8IXN7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIMKLAQ8IXN7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RIMKLAQ8IXN7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIMKLAQ8IXN7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIMKLAQ8IXN7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIMKLAQ8IXN7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIMKLAQ8IXN7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIMKLAQ8IXN7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIMKLAQ8IXN7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIMKLAQ8IXN7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RIMKLAQ8IXN7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIMKLAQ8IXN7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIMKLAQ8IXN7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RIMKLAQ8IXN7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIMKLAQ8IXN7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIMKLAQ8IXN7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIMKLAQ8IXN7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIMKLAQ8IXN7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RIMKLAQ8IXN7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIMKLAQ8IXN7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIMKLAQ8IXN7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIMKLAQ8IXN7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIMKLAQ8IXN7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms