Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVD9

NUDCD3, NudC domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD3Q8IVD9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUDCD3Q8IVD9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUDCD3Q8IVD9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUDCD3Q8IVD9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUDCD3Q8IVD9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUDCD3Q8IVD9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUDCD3Q8IVD9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUDCD3Q8IVD9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUDCD3Q8IVD9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NUDCD3Q8IVD9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUDCD3Q8IVD9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUDCD3Q8IVD9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUDCD3Q8IVD9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUDCD3Q8IVD9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUDCD3Q8IVD9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUDCD3Q8IVD9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUDCD3Q8IVD9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUDCD3Q8IVD9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUDCD3Q8IVD9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUDCD3Q8IVD9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUDCD3Q8IVD9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUDCD3Q8IVD9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUDCD3Q8IVD9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUDCD3Q8IVD9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NUDCD3Q8IVD9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUDCD3Q8IVD9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUDCD3Q8IVD9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUDCD3Q8IVD9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUDCD3Q8IVD9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUDCD3Q8IVD9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUDCD3Q8IVD9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUDCD3Q8IVD9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUDCD3Q8IVD9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUDCD3Q8IVD9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUDCD3Q8IVD9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUDCD3Q8IVD9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUDCD3Q8IVD9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUDCD3Q8IVD9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUDCD3Q8IVD9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUDCD3Q8IVD9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUDCD3Q8IVD9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUDCD3Q8IVD9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUDCD3Q8IVD9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUDCD3Q8IVD9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUDCD3Q8IVD9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUDCD3Q8IVD9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUDCD3Q8IVD9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUDCD3Q8IVD9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUDCD3Q8IVD9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUDCD3Q8IVD9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUDCD3Q8IVD9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUDCD3Q8IVD9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUDCD3Q8IVD9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUDCD3Q8IVD9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUDCD3Q8IVD9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUDCD3Q8IVD9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUDCD3Q8IVD9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUDCD3Q8IVD9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUDCD3Q8IVD9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUDCD3Q8IVD9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUDCD3Q8IVD9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUDCD3Q8IVD9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUDCD3Q8IVD9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUDCD3Q8IVD9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUDCD3Q8IVD9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUDCD3Q8IVD9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUDCD3Q8IVD9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUDCD3Q8IVD9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUDCD3Q8IVD9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUDCD3Q8IVD9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUDCD3Q8IVD9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUDCD3Q8IVD9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUDCD3Q8IVD9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUDCD3Q8IVD9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NUDCD3Q8IVD9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUDCD3Q8IVD9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUDCD3Q8IVD9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUDCD3Q8IVD9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUDCD3Q8IVD9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUDCD3Q8IVD9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUDCD3Q8IVD9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUDCD3Q8IVD9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUDCD3Q8IVD9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUDCD3Q8IVD9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUDCD3Q8IVD9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUDCD3Q8IVD9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUDCD3Q8IVD9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUDCD3Q8IVD9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NUDCD3Q8IVD9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUDCD3Q8IVD9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NUDCD3Q8IVD9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUDCD3Q8IVD9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUDCD3Q8IVD9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUDCD3Q8IVD9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUDCD3Q8IVD9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NUDCD3Q8IVD9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUDCD3Q8IVD9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUDCD3Q8IVD9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUDCD3Q8IVD9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUDCD3Q8IVD9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms