Protein–RNA interactions for Protein: Q86UP9

LHFPL3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHFPL3Q86UP9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LHFPL3Q86UP9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LHFPL3Q86UP9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LHFPL3Q86UP9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LHFPL3Q86UP9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LHFPL3Q86UP9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LHFPL3Q86UP9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LHFPL3Q86UP9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LHFPL3Q86UP9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LHFPL3Q86UP9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LHFPL3Q86UP9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LHFPL3Q86UP9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LHFPL3Q86UP9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LHFPL3Q86UP9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LHFPL3Q86UP9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LHFPL3Q86UP9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LHFPL3Q86UP9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LHFPL3Q86UP9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LHFPL3Q86UP9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LHFPL3Q86UP9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LHFPL3Q86UP9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LHFPL3Q86UP9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LHFPL3Q86UP9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LHFPL3Q86UP9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LHFPL3Q86UP9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LHFPL3Q86UP9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LHFPL3Q86UP9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LHFPL3Q86UP9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LHFPL3Q86UP9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LHFPL3Q86UP9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LHFPL3Q86UP9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LHFPL3Q86UP9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LHFPL3Q86UP9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LHFPL3Q86UP9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHFPL3Q86UP9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHFPL3Q86UP9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHFPL3Q86UP9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHFPL3Q86UP9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHFPL3Q86UP9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LHFPL3Q86UP9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHFPL3Q86UP9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LHFPL3Q86UP9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LHFPL3Q86UP9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LHFPL3Q86UP9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LHFPL3Q86UP9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LHFPL3Q86UP9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LHFPL3Q86UP9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LHFPL3Q86UP9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LHFPL3Q86UP9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LHFPL3Q86UP9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LHFPL3Q86UP9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LHFPL3Q86UP9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LHFPL3Q86UP9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LHFPL3Q86UP9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LHFPL3Q86UP9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LHFPL3Q86UP9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LHFPL3Q86UP9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LHFPL3Q86UP9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LHFPL3Q86UP9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LHFPL3Q86UP9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LHFPL3Q86UP9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LHFPL3Q86UP9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHFPL3Q86UP9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHFPL3Q86UP9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHFPL3Q86UP9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHFPL3Q86UP9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHFPL3Q86UP9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHFPL3Q86UP9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHFPL3Q86UP9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHFPL3Q86UP9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHFPL3Q86UP9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHFPL3Q86UP9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHFPL3Q86UP9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LHFPL3Q86UP9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHFPL3Q86UP9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHFPL3Q86UP9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHFPL3Q86UP9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHFPL3Q86UP9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LHFPL3Q86UP9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LHFPL3Q86UP9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LHFPL3Q86UP9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LHFPL3Q86UP9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LHFPL3Q86UP9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LHFPL3Q86UP9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LHFPL3Q86UP9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHFPL3Q86UP9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHFPL3Q86UP9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHFPL3Q86UP9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LHFPL3Q86UP9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHFPL3Q86UP9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LHFPL3Q86UP9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LHFPL3Q86UP9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LHFPL3Q86UP9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LHFPL3Q86UP9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LHFPL3Q86UP9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHFPL3Q86UP9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHFPL3Q86UP9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHFPL3Q86UP9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHFPL3Q86UP9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHFPL3Q86UP9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms