Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NLRP9Q7RTR0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NLRP9Q7RTR0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NLRP9Q7RTR0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NLRP9Q7RTR0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NLRP9Q7RTR0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NLRP9Q7RTR0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NLRP9Q7RTR0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NLRP9Q7RTR0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NLRP9Q7RTR0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NLRP9Q7RTR0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NLRP9Q7RTR0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NLRP9Q7RTR0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NLRP9Q7RTR0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NLRP9Q7RTR0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRP9Q7RTR0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRP9Q7RTR0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRP9Q7RTR0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRP9Q7RTR0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP9Q7RTR0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP9Q7RTR0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP9Q7RTR0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP9Q7RTR0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP9Q7RTR0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP9Q7RTR0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP9Q7RTR0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NLRP9Q7RTR0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRP9Q7RTR0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRP9Q7RTR0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRP9Q7RTR0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRP9Q7RTR0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRP9Q7RTR0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRP9Q7RTR0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRP9Q7RTR0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRP9Q7RTR0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRP9Q7RTR0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRP9Q7RTR0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP9Q7RTR0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP9Q7RTR0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP9Q7RTR0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP9Q7RTR0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP9Q7RTR0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP9Q7RTR0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP9Q7RTR0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP9Q7RTR0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP9Q7RTR0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP9Q7RTR0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP9Q7RTR0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP9Q7RTR0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP9Q7RTR0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRP9Q7RTR0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRP9Q7RTR0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms