Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV60

LINC00173, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00173, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00173Q6ZV60 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00173Q6ZV60 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00173Q6ZV60 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00173Q6ZV60 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00173Q6ZV60 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00173Q6ZV60 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00173Q6ZV60 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00173Q6ZV60 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00173Q6ZV60 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00173Q6ZV60 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00173Q6ZV60 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00173Q6ZV60 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00173Q6ZV60 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00173Q6ZV60 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00173Q6ZV60 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00173Q6ZV60 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00173Q6ZV60 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00173Q6ZV60 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00173Q6ZV60 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00173Q6ZV60 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00173Q6ZV60 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00173Q6ZV60 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00173Q6ZV60 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00173Q6ZV60 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00173Q6ZV60 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00173Q6ZV60 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00173Q6ZV60 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00173Q6ZV60 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00173Q6ZV60 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00173Q6ZV60 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00173Q6ZV60 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00173Q6ZV60 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00173Q6ZV60 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00173Q6ZV60 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00173Q6ZV60 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00173Q6ZV60 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00173Q6ZV60 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00173Q6ZV60 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00173Q6ZV60 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00173Q6ZV60 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00173Q6ZV60 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00173Q6ZV60 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00173Q6ZV60 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00173Q6ZV60 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00173Q6ZV60 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LINC00173Q6ZV60 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LINC00173Q6ZV60 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LINC00173Q6ZV60 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00173Q6ZV60 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00173Q6ZV60 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00173Q6ZV60 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00173Q6ZV60 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00173Q6ZV60 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00173Q6ZV60 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00173Q6ZV60 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00173Q6ZV60 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00173Q6ZV60 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00173Q6ZV60 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00173Q6ZV60 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00173Q6ZV60 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00173Q6ZV60 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00173Q6ZV60 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00173Q6ZV60 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00173Q6ZV60 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00173Q6ZV60 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00173Q6ZV60 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00173Q6ZV60 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00173Q6ZV60 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LINC00173Q6ZV60 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00173Q6ZV60 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00173Q6ZV60 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00173Q6ZV60 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00173Q6ZV60 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00173Q6ZV60 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00173Q6ZV60 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00173Q6ZV60 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00173Q6ZV60 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00173Q6ZV60 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00173Q6ZV60 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00173Q6ZV60 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00173Q6ZV60 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00173Q6ZV60 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00173Q6ZV60 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00173Q6ZV60 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00173Q6ZV60 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00173Q6ZV60 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00173Q6ZV60 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00173Q6ZV60 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00173Q6ZV60 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00173Q6ZV60 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00173Q6ZV60 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00173Q6ZV60 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00173Q6ZV60 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00173Q6ZV60 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00173Q6ZV60 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00173Q6ZV60 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00173Q6ZV60 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00173Q6ZV60 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00173Q6ZV60 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00173Q6ZV60 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms