Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00299Q6ZSB3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00299Q6ZSB3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00299Q6ZSB3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00299Q6ZSB3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00299Q6ZSB3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00299Q6ZSB3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00299Q6ZSB3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00299Q6ZSB3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00299Q6ZSB3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00299Q6ZSB3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00299Q6ZSB3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00299Q6ZSB3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00299Q6ZSB3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00299Q6ZSB3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00299Q6ZSB3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
LINC00299Q6ZSB3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00299Q6ZSB3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00299Q6ZSB3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00299Q6ZSB3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00299Q6ZSB3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00299Q6ZSB3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00299Q6ZSB3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00299Q6ZSB3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00299Q6ZSB3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00299Q6ZSB3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00299Q6ZSB3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00299Q6ZSB3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00299Q6ZSB3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00299Q6ZSB3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00299Q6ZSB3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00299Q6ZSB3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00299Q6ZSB3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00299Q6ZSB3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00299Q6ZSB3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00299Q6ZSB3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00299Q6ZSB3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00299Q6ZSB3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00299Q6ZSB3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00299Q6ZSB3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00299Q6ZSB3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00299Q6ZSB3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LINC00299Q6ZSB3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00299Q6ZSB3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00299Q6ZSB3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00299Q6ZSB3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00299Q6ZSB3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00299Q6ZSB3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00299Q6ZSB3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00299Q6ZSB3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00299Q6ZSB3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00299Q6ZSB3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00299Q6ZSB3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00299Q6ZSB3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00299Q6ZSB3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00299Q6ZSB3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00299Q6ZSB3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00299Q6ZSB3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00299Q6ZSB3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00299Q6ZSB3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00299Q6ZSB3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00299Q6ZSB3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00299Q6ZSB3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00299Q6ZSB3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LINC00299Q6ZSB3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00299Q6ZSB3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00299Q6ZSB3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00299Q6ZSB3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00299Q6ZSB3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00299Q6ZSB3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00299Q6ZSB3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00299Q6ZSB3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00299Q6ZSB3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00299Q6ZSB3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00299Q6ZSB3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00299Q6ZSB3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00299Q6ZSB3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00299Q6ZSB3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00299Q6ZSB3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00299Q6ZSB3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00299Q6ZSB3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00299Q6ZSB3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC00299Q6ZSB3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC00299Q6ZSB3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC00299Q6ZSB3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC00299Q6ZSB3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LINC00299Q6ZSB3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00299Q6ZSB3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00299Q6ZSB3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00299Q6ZSB3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00299Q6ZSB3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00299Q6ZSB3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00299Q6ZSB3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00299Q6ZSB3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00299Q6ZSB3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00299Q6ZSB3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00299Q6ZSB3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00299Q6ZSB3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms