Protein–RNA interactions for Protein: Q6VVB1

NHLRC1, E3 ubiquitin-protein ligase NHLRC1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC1Q6VVB1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NHLRC1Q6VVB1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NHLRC1Q6VVB1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NHLRC1Q6VVB1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NHLRC1Q6VVB1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NHLRC1Q6VVB1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NHLRC1Q6VVB1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NHLRC1Q6VVB1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NHLRC1Q6VVB1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NHLRC1Q6VVB1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NHLRC1Q6VVB1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NHLRC1Q6VVB1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NHLRC1Q6VVB1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NHLRC1Q6VVB1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NHLRC1Q6VVB1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NHLRC1Q6VVB1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NHLRC1Q6VVB1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NHLRC1Q6VVB1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NHLRC1Q6VVB1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NHLRC1Q6VVB1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NHLRC1Q6VVB1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NHLRC1Q6VVB1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NHLRC1Q6VVB1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NHLRC1Q6VVB1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NHLRC1Q6VVB1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NHLRC1Q6VVB1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NHLRC1Q6VVB1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NHLRC1Q6VVB1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NHLRC1Q6VVB1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NHLRC1Q6VVB1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NHLRC1Q6VVB1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NHLRC1Q6VVB1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NHLRC1Q6VVB1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NHLRC1Q6VVB1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NHLRC1Q6VVB1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NHLRC1Q6VVB1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NHLRC1Q6VVB1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NHLRC1Q6VVB1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NHLRC1Q6VVB1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NHLRC1Q6VVB1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NHLRC1Q6VVB1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NHLRC1Q6VVB1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NHLRC1Q6VVB1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NHLRC1Q6VVB1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NHLRC1Q6VVB1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NHLRC1Q6VVB1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NHLRC1Q6VVB1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NHLRC1Q6VVB1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NHLRC1Q6VVB1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NHLRC1Q6VVB1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NHLRC1Q6VVB1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NHLRC1Q6VVB1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NHLRC1Q6VVB1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NHLRC1Q6VVB1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NHLRC1Q6VVB1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NHLRC1Q6VVB1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NHLRC1Q6VVB1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NHLRC1Q6VVB1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NHLRC1Q6VVB1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NHLRC1Q6VVB1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NHLRC1Q6VVB1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NHLRC1Q6VVB1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NHLRC1Q6VVB1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NHLRC1Q6VVB1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NHLRC1Q6VVB1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NHLRC1Q6VVB1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NHLRC1Q6VVB1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NHLRC1Q6VVB1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NHLRC1Q6VVB1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NHLRC1Q6VVB1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NHLRC1Q6VVB1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NHLRC1Q6VVB1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NHLRC1Q6VVB1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NHLRC1Q6VVB1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NHLRC1Q6VVB1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NHLRC1Q6VVB1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NHLRC1Q6VVB1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NHLRC1Q6VVB1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NHLRC1Q6VVB1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NHLRC1Q6VVB1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NHLRC1Q6VVB1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NHLRC1Q6VVB1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NHLRC1Q6VVB1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NHLRC1Q6VVB1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NHLRC1Q6VVB1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NHLRC1Q6VVB1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NHLRC1Q6VVB1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NHLRC1Q6VVB1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NHLRC1Q6VVB1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NHLRC1Q6VVB1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NHLRC1Q6VVB1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NHLRC1Q6VVB1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NHLRC1Q6VVB1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NHLRC1Q6VVB1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NHLRC1Q6VVB1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NHLRC1Q6VVB1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NHLRC1Q6VVB1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NHLRC1Q6VVB1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NHLRC1Q6VVB1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NHLRC1Q6VVB1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms