Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
VSTM1Q6UX27 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
VSTM1Q6UX27 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
VSTM1Q6UX27 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
VSTM1Q6UX27 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VSTM1Q6UX27 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VSTM1Q6UX27 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VSTM1Q6UX27 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VSTM1Q6UX27 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VSTM1Q6UX27 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VSTM1Q6UX27 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VSTM1Q6UX27 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
VSTM1Q6UX27 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
VSTM1Q6UX27 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
VSTM1Q6UX27 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
VSTM1Q6UX27 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
VSTM1Q6UX27 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VSTM1Q6UX27 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VSTM1Q6UX27 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VSTM1Q6UX27 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
VSTM1Q6UX27 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VSTM1Q6UX27 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VSTM1Q6UX27 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VSTM1Q6UX27 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VSTM1Q6UX27 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VSTM1Q6UX27 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VSTM1Q6UX27 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VSTM1Q6UX27 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VSTM1Q6UX27 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VSTM1Q6UX27 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VSTM1Q6UX27 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VSTM1Q6UX27 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VSTM1Q6UX27 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VSTM1Q6UX27 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VSTM1Q6UX27 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VSTM1Q6UX27 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VSTM1Q6UX27 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VSTM1Q6UX27 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VSTM1Q6UX27 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VSTM1Q6UX27 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VSTM1Q6UX27 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VSTM1Q6UX27 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VSTM1Q6UX27 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
VSTM1Q6UX27 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VSTM1Q6UX27 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VSTM1Q6UX27 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VSTM1Q6UX27 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VSTM1Q6UX27 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VSTM1Q6UX27 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VSTM1Q6UX27 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VSTM1Q6UX27 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VSTM1Q6UX27 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VSTM1Q6UX27 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VSTM1Q6UX27 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VSTM1Q6UX27 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VSTM1Q6UX27 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VSTM1Q6UX27 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
VSTM1Q6UX27 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VSTM1Q6UX27 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VSTM1Q6UX27 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
VSTM1Q6UX27 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VSTM1Q6UX27 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VSTM1Q6UX27 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VSTM1Q6UX27 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VSTM1Q6UX27 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VSTM1Q6UX27 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VSTM1Q6UX27 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VSTM1Q6UX27 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VSTM1Q6UX27 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VSTM1Q6UX27 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VSTM1Q6UX27 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
VSTM1Q6UX27 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
VSTM1Q6UX27 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VSTM1Q6UX27 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VSTM1Q6UX27 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VSTM1Q6UX27 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VSTM1Q6UX27 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VSTM1Q6UX27 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VSTM1Q6UX27 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VSTM1Q6UX27 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VSTM1Q6UX27 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VSTM1Q6UX27 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VSTM1Q6UX27 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VSTM1Q6UX27 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VSTM1Q6UX27 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VSTM1Q6UX27 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VSTM1Q6UX27 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VSTM1Q6UX27 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VSTM1Q6UX27 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VSTM1Q6UX27 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
VSTM1Q6UX27 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VSTM1Q6UX27 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VSTM1Q6UX27 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
VSTM1Q6UX27 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VSTM1Q6UX27 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VSTM1Q6UX27 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VSTM1Q6UX27 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VSTM1Q6UX27 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VSTM1Q6UX27 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VSTM1Q6UX27 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162 ms