Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC171Q6TFL3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC171Q6TFL3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC171Q6TFL3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC171Q6TFL3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC171Q6TFL3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC171Q6TFL3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC171Q6TFL3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC171Q6TFL3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC171Q6TFL3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
CCDC171Q6TFL3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CCDC171Q6TFL3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CCDC171Q6TFL3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CCDC171Q6TFL3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CCDC171Q6TFL3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC171Q6TFL3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC171Q6TFL3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC171Q6TFL3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC171Q6TFL3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC171Q6TFL3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC171Q6TFL3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC171Q6TFL3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC171Q6TFL3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC171Q6TFL3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC171Q6TFL3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC171Q6TFL3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC171Q6TFL3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC171Q6TFL3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC171Q6TFL3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC171Q6TFL3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC171Q6TFL3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC171Q6TFL3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC171Q6TFL3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
CCDC171Q6TFL3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC171Q6TFL3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC171Q6TFL3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC171Q6TFL3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC171Q6TFL3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC171Q6TFL3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC171Q6TFL3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC171Q6TFL3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CCDC171Q6TFL3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CCDC171Q6TFL3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CCDC171Q6TFL3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CCDC171Q6TFL3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CCDC171Q6TFL3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CCDC171Q6TFL3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CCDC171Q6TFL3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CCDC171Q6TFL3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC171Q6TFL3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC171Q6TFL3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC171Q6TFL3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC171Q6TFL3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC171Q6TFL3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CCDC171Q6TFL3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CCDC171Q6TFL3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CCDC171Q6TFL3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CCDC171Q6TFL3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CCDC171Q6TFL3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CCDC171Q6TFL3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CCDC171Q6TFL3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CCDC171Q6TFL3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
CCDC171Q6TFL3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CCDC171Q6TFL3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CCDC171Q6TFL3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CCDC171Q6TFL3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC171Q6TFL3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC171Q6TFL3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC171Q6TFL3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC171Q6TFL3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC171Q6TFL3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC171Q6TFL3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC171Q6TFL3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC171Q6TFL3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC171Q6TFL3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC171Q6TFL3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC171Q6TFL3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC171Q6TFL3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC171Q6TFL3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC171Q6TFL3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
CCDC171Q6TFL3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC171Q6TFL3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC171Q6TFL3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC171Q6TFL3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC171Q6TFL3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC171Q6TFL3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC171Q6TFL3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC171Q6TFL3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC171Q6TFL3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC171Q6TFL3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC171Q6TFL3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CCDC171Q6TFL3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CCDC171Q6TFL3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CCDC171Q6TFL3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CCDC171Q6TFL3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CCDC171Q6TFL3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CCDC171Q6TFL3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CCDC171Q6TFL3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CCDC171Q6TFL3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CCDC171Q6TFL3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms