Protein–RNA interactions for Protein: Q6RI45

BRWD3, Bromodomain and WD repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRWD3Q6RI45 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
BRWD3Q6RI45 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
BRWD3Q6RI45 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
BRWD3Q6RI45 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
BRWD3Q6RI45 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
BRWD3Q6RI45 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
BRWD3Q6RI45 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
BRWD3Q6RI45 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC34.46■■■■□ 3.11
BRWD3Q6RI45 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
BRWD3Q6RI45 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
BRWD3Q6RI45 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
BRWD3Q6RI45 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
BRWD3Q6RI45 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
BRWD3Q6RI45 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC34.44■■■■□ 3.1
BRWD3Q6RI45 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
BRWD3Q6RI45 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
BRWD3Q6RI45 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
BRWD3Q6RI45 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
BRWD3Q6RI45 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
BRWD3Q6RI45 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
BRWD3Q6RI45 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
BRWD3Q6RI45 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
BRWD3Q6RI45 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
BRWD3Q6RI45 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
BRWD3Q6RI45 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
BRWD3Q6RI45 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
BRWD3Q6RI45 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
BRWD3Q6RI45 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
BRWD3Q6RI45 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
BRWD3Q6RI45 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
BRWD3Q6RI45 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
BRWD3Q6RI45 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
BRWD3Q6RI45 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
BRWD3Q6RI45 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
BRWD3Q6RI45 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
BRWD3Q6RI45 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
BRWD3Q6RI45 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
BRWD3Q6RI45 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
BRWD3Q6RI45 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
BRWD3Q6RI45 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.09
BRWD3Q6RI45 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC34.32■■■■□ 3.09
BRWD3Q6RI45 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
BRWD3Q6RI45 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
BRWD3Q6RI45 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
BRWD3Q6RI45 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
BRWD3Q6RI45 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
BRWD3Q6RI45 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
BRWD3Q6RI45 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
BRWD3Q6RI45 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
BRWD3Q6RI45 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
BRWD3Q6RI45 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
BRWD3Q6RI45 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
BRWD3Q6RI45 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
BRWD3Q6RI45 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
BRWD3Q6RI45 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
BRWD3Q6RI45 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
BRWD3Q6RI45 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
BRWD3Q6RI45 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
BRWD3Q6RI45 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
BRWD3Q6RI45 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
BRWD3Q6RI45 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
BRWD3Q6RI45 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
BRWD3Q6RI45 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
BRWD3Q6RI45 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
BRWD3Q6RI45 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
BRWD3Q6RI45 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
BRWD3Q6RI45 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
BRWD3Q6RI45 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
BRWD3Q6RI45 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
BRWD3Q6RI45 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
BRWD3Q6RI45 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
BRWD3Q6RI45 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
BRWD3Q6RI45 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
BRWD3Q6RI45 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
BRWD3Q6RI45 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
BRWD3Q6RI45 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
BRWD3Q6RI45 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
BRWD3Q6RI45 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
BRWD3Q6RI45 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
BRWD3Q6RI45 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
BRWD3Q6RI45 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
BRWD3Q6RI45 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
BRWD3Q6RI45 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
BRWD3Q6RI45 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
BRWD3Q6RI45 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
BRWD3Q6RI45 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
BRWD3Q6RI45 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
BRWD3Q6RI45 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
BRWD3Q6RI45 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
BRWD3Q6RI45 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
BRWD3Q6RI45 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
BRWD3Q6RI45 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
BRWD3Q6RI45 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
BRWD3Q6RI45 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC34.13■■■■□ 3.05
BRWD3Q6RI45 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
BRWD3Q6RI45 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
BRWD3Q6RI45 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
BRWD3Q6RI45 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
BRWD3Q6RI45 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
BRWD3Q6RI45 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms