Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJG9

LRFN4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN4Q6PJG9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRFN4Q6PJG9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRFN4Q6PJG9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRFN4Q6PJG9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRFN4Q6PJG9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRFN4Q6PJG9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRFN4Q6PJG9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRFN4Q6PJG9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRFN4Q6PJG9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRFN4Q6PJG9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRFN4Q6PJG9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRFN4Q6PJG9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRFN4Q6PJG9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRFN4Q6PJG9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRFN4Q6PJG9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRFN4Q6PJG9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRFN4Q6PJG9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRFN4Q6PJG9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRFN4Q6PJG9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRFN4Q6PJG9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LRFN4Q6PJG9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRFN4Q6PJG9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRFN4Q6PJG9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRFN4Q6PJG9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRFN4Q6PJG9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRFN4Q6PJG9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRFN4Q6PJG9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRFN4Q6PJG9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRFN4Q6PJG9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRFN4Q6PJG9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRFN4Q6PJG9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRFN4Q6PJG9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRFN4Q6PJG9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRFN4Q6PJG9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRFN4Q6PJG9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRFN4Q6PJG9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRFN4Q6PJG9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRFN4Q6PJG9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRFN4Q6PJG9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRFN4Q6PJG9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRFN4Q6PJG9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRFN4Q6PJG9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LRFN4Q6PJG9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRFN4Q6PJG9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRFN4Q6PJG9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRFN4Q6PJG9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRFN4Q6PJG9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRFN4Q6PJG9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRFN4Q6PJG9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LRFN4Q6PJG9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRFN4Q6PJG9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LRFN4Q6PJG9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRFN4Q6PJG9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRFN4Q6PJG9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRFN4Q6PJG9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRFN4Q6PJG9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRFN4Q6PJG9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRFN4Q6PJG9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRFN4Q6PJG9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRFN4Q6PJG9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRFN4Q6PJG9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRFN4Q6PJG9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRFN4Q6PJG9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRFN4Q6PJG9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRFN4Q6PJG9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRFN4Q6PJG9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRFN4Q6PJG9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRFN4Q6PJG9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRFN4Q6PJG9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRFN4Q6PJG9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRFN4Q6PJG9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRFN4Q6PJG9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LRFN4Q6PJG9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRFN4Q6PJG9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRFN4Q6PJG9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRFN4Q6PJG9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LRFN4Q6PJG9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRFN4Q6PJG9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRFN4Q6PJG9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LRFN4Q6PJG9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRFN4Q6PJG9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRFN4Q6PJG9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRFN4Q6PJG9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRFN4Q6PJG9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRFN4Q6PJG9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRFN4Q6PJG9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRFN4Q6PJG9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRFN4Q6PJG9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRFN4Q6PJG9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRFN4Q6PJG9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRFN4Q6PJG9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRFN4Q6PJG9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRFN4Q6PJG9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRFN4Q6PJG9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LRFN4Q6PJG9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRFN4Q6PJG9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRFN4Q6PJG9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRFN4Q6PJG9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRFN4Q6PJG9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRFN4Q6PJG9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms