Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
LMOD2Q6P5Q4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
LMOD2Q6P5Q4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
LMOD2Q6P5Q4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC35.47■■■■□ 3.27
LMOD2Q6P5Q4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
LMOD2Q6P5Q4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
LMOD2Q6P5Q4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
LMOD2Q6P5Q4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
LMOD2Q6P5Q4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
LMOD2Q6P5Q4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
LMOD2Q6P5Q4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
LMOD2Q6P5Q4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
LMOD2Q6P5Q4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
LMOD2Q6P5Q4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
LMOD2Q6P5Q4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC35.43■■■■□ 3.26
LMOD2Q6P5Q4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
LMOD2Q6P5Q4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
LMOD2Q6P5Q4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
LMOD2Q6P5Q4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
LMOD2Q6P5Q4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
LMOD2Q6P5Q4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
LMOD2Q6P5Q4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
LMOD2Q6P5Q4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
LMOD2Q6P5Q4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
LMOD2Q6P5Q4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
LMOD2Q6P5Q4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
LMOD2Q6P5Q4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
LMOD2Q6P5Q4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
LMOD2Q6P5Q4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
LMOD2Q6P5Q4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
LMOD2Q6P5Q4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
LMOD2Q6P5Q4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
LMOD2Q6P5Q4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
LMOD2Q6P5Q4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
LMOD2Q6P5Q4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
LMOD2Q6P5Q4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
LMOD2Q6P5Q4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
LMOD2Q6P5Q4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
LMOD2Q6P5Q4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
LMOD2Q6P5Q4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
LMOD2Q6P5Q4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
LMOD2Q6P5Q4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
LMOD2Q6P5Q4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
LMOD2Q6P5Q4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
LMOD2Q6P5Q4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
LMOD2Q6P5Q4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
LMOD2Q6P5Q4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
LMOD2Q6P5Q4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
LMOD2Q6P5Q4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
LMOD2Q6P5Q4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
LMOD2Q6P5Q4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
LMOD2Q6P5Q4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
LMOD2Q6P5Q4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
LMOD2Q6P5Q4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
LMOD2Q6P5Q4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
LMOD2Q6P5Q4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
LMOD2Q6P5Q4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
LMOD2Q6P5Q4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
LMOD2Q6P5Q4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
LMOD2Q6P5Q4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
LMOD2Q6P5Q4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
LMOD2Q6P5Q4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
LMOD2Q6P5Q4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
LMOD2Q6P5Q4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
LMOD2Q6P5Q4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
LMOD2Q6P5Q4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
LMOD2Q6P5Q4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
LMOD2Q6P5Q4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
LMOD2Q6P5Q4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
LMOD2Q6P5Q4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
LMOD2Q6P5Q4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
LMOD2Q6P5Q4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
LMOD2Q6P5Q4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
LMOD2Q6P5Q4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
LMOD2Q6P5Q4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
LMOD2Q6P5Q4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
LMOD2Q6P5Q4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
LMOD2Q6P5Q4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
LMOD2Q6P5Q4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
LMOD2Q6P5Q4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
LMOD2Q6P5Q4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
LMOD2Q6P5Q4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
LMOD2Q6P5Q4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
LMOD2Q6P5Q4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
LMOD2Q6P5Q4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
LMOD2Q6P5Q4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
LMOD2Q6P5Q4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
LMOD2Q6P5Q4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
LMOD2Q6P5Q4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
LMOD2Q6P5Q4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
LMOD2Q6P5Q4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
LMOD2Q6P5Q4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
LMOD2Q6P5Q4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC35.09■■■■□ 3.21
LMOD2Q6P5Q4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
LMOD2Q6P5Q4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
LMOD2Q6P5Q4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
LMOD2Q6P5Q4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
LMOD2Q6P5Q4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
LMOD2Q6P5Q4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
LMOD2Q6P5Q4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms