Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRNP1Q6NT89 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRNP1Q6NT89 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRNP1Q6NT89 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRNP1Q6NT89 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRNP1Q6NT89 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRNP1Q6NT89 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRNP1Q6NT89 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRNP1Q6NT89 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRNP1Q6NT89 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRNP1Q6NT89 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TRNP1Q6NT89 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRNP1Q6NT89 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRNP1Q6NT89 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRNP1Q6NT89 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRNP1Q6NT89 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRNP1Q6NT89 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRNP1Q6NT89 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRNP1Q6NT89 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRNP1Q6NT89 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRNP1Q6NT89 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRNP1Q6NT89 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRNP1Q6NT89 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRNP1Q6NT89 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRNP1Q6NT89 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRNP1Q6NT89 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRNP1Q6NT89 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRNP1Q6NT89 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRNP1Q6NT89 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRNP1Q6NT89 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRNP1Q6NT89 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRNP1Q6NT89 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRNP1Q6NT89 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRNP1Q6NT89 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRNP1Q6NT89 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRNP1Q6NT89 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRNP1Q6NT89 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRNP1Q6NT89 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRNP1Q6NT89 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRNP1Q6NT89 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRNP1Q6NT89 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRNP1Q6NT89 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRNP1Q6NT89 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRNP1Q6NT89 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRNP1Q6NT89 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRNP1Q6NT89 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRNP1Q6NT89 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRNP1Q6NT89 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRNP1Q6NT89 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRNP1Q6NT89 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRNP1Q6NT89 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRNP1Q6NT89 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRNP1Q6NT89 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRNP1Q6NT89 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRNP1Q6NT89 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRNP1Q6NT89 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRNP1Q6NT89 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRNP1Q6NT89 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRNP1Q6NT89 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRNP1Q6NT89 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRNP1Q6NT89 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRNP1Q6NT89 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRNP1Q6NT89 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRNP1Q6NT89 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRNP1Q6NT89 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRNP1Q6NT89 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRNP1Q6NT89 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRNP1Q6NT89 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRNP1Q6NT89 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TRNP1Q6NT89 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRNP1Q6NT89 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRNP1Q6NT89 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRNP1Q6NT89 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRNP1Q6NT89 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRNP1Q6NT89 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TRNP1Q6NT89 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRNP1Q6NT89 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRNP1Q6NT89 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRNP1Q6NT89 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRNP1Q6NT89 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRNP1Q6NT89 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRNP1Q6NT89 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRNP1Q6NT89 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRNP1Q6NT89 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRNP1Q6NT89 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRNP1Q6NT89 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRNP1Q6NT89 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRNP1Q6NT89 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRNP1Q6NT89 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRNP1Q6NT89 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRNP1Q6NT89 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRNP1Q6NT89 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRNP1Q6NT89 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TRNP1Q6NT89 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRNP1Q6NT89 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRNP1Q6NT89 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRNP1Q6NT89 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TRNP1Q6NT89 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRNP1Q6NT89 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRNP1Q6NT89 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms