Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPM2

IQCE, IQ domain-containing protein E, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQCEQ6IPM2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
IQCEQ6IPM2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
IQCEQ6IPM2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
IQCEQ6IPM2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IQCEQ6IPM2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
IQCEQ6IPM2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IQCEQ6IPM2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IQCEQ6IPM2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IQCEQ6IPM2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IQCEQ6IPM2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IQCEQ6IPM2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IQCEQ6IPM2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IQCEQ6IPM2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IQCEQ6IPM2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IQCEQ6IPM2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IQCEQ6IPM2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IQCEQ6IPM2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IQCEQ6IPM2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IQCEQ6IPM2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IQCEQ6IPM2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IQCEQ6IPM2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IQCEQ6IPM2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IQCEQ6IPM2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
IQCEQ6IPM2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IQCEQ6IPM2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IQCEQ6IPM2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IQCEQ6IPM2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IQCEQ6IPM2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IQCEQ6IPM2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IQCEQ6IPM2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IQCEQ6IPM2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IQCEQ6IPM2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IQCEQ6IPM2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IQCEQ6IPM2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IQCEQ6IPM2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IQCEQ6IPM2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IQCEQ6IPM2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IQCEQ6IPM2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IQCEQ6IPM2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IQCEQ6IPM2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IQCEQ6IPM2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IQCEQ6IPM2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IQCEQ6IPM2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IQCEQ6IPM2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IQCEQ6IPM2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IQCEQ6IPM2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IQCEQ6IPM2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IQCEQ6IPM2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IQCEQ6IPM2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IQCEQ6IPM2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IQCEQ6IPM2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IQCEQ6IPM2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
IQCEQ6IPM2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
IQCEQ6IPM2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28■■■□□ 2.07
IQCEQ6IPM2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IQCEQ6IPM2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IQCEQ6IPM2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IQCEQ6IPM2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IQCEQ6IPM2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IQCEQ6IPM2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IQCEQ6IPM2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IQCEQ6IPM2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IQCEQ6IPM2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
IQCEQ6IPM2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
IQCEQ6IPM2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
IQCEQ6IPM2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
IQCEQ6IPM2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
IQCEQ6IPM2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IQCEQ6IPM2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IQCEQ6IPM2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IQCEQ6IPM2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IQCEQ6IPM2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IQCEQ6IPM2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IQCEQ6IPM2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IQCEQ6IPM2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IQCEQ6IPM2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IQCEQ6IPM2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IQCEQ6IPM2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IQCEQ6IPM2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IQCEQ6IPM2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IQCEQ6IPM2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IQCEQ6IPM2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
IQCEQ6IPM2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IQCEQ6IPM2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
IQCEQ6IPM2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IQCEQ6IPM2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
IQCEQ6IPM2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
IQCEQ6IPM2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
IQCEQ6IPM2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
IQCEQ6IPM2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
IQCEQ6IPM2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
IQCEQ6IPM2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
IQCEQ6IPM2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
IQCEQ6IPM2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
IQCEQ6IPM2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IQCEQ6IPM2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IQCEQ6IPM2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
IQCEQ6IPM2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IQCEQ6IPM2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IQCEQ6IPM2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms