Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
MCTP1Q6DN14 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
MCTP1Q6DN14 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
MCTP1Q6DN14 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
MCTP1Q6DN14 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
MCTP1Q6DN14 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
MCTP1Q6DN14 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
MCTP1Q6DN14 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
MCTP1Q6DN14 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
MCTP1Q6DN14 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
MCTP1Q6DN14 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
MCTP1Q6DN14 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
MCTP1Q6DN14 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
MCTP1Q6DN14 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MCTP1Q6DN14 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MCTP1Q6DN14 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MCTP1Q6DN14 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
MCTP1Q6DN14 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
MCTP1Q6DN14 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MCTP1Q6DN14 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MCTP1Q6DN14 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MCTP1Q6DN14 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MCTP1Q6DN14 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MCTP1Q6DN14 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MCTP1Q6DN14 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MCTP1Q6DN14 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
MCTP1Q6DN14 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
MCTP1Q6DN14 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MCTP1Q6DN14 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
MCTP1Q6DN14 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
MCTP1Q6DN14 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MCTP1Q6DN14 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MCTP1Q6DN14 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
MCTP1Q6DN14 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
MCTP1Q6DN14 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
MCTP1Q6DN14 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MCTP1Q6DN14 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MCTP1Q6DN14 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
MCTP1Q6DN14 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
MCTP1Q6DN14 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
MCTP1Q6DN14 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
MCTP1Q6DN14 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
MCTP1Q6DN14 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
MCTP1Q6DN14 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC30■■■□□ 2.39
MCTP1Q6DN14 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MCTP1Q6DN14 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MCTP1Q6DN14 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MCTP1Q6DN14 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
MCTP1Q6DN14 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MCTP1Q6DN14 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MCTP1Q6DN14 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
MCTP1Q6DN14 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
MCTP1Q6DN14 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
MCTP1Q6DN14 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
MCTP1Q6DN14 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
MCTP1Q6DN14 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
MCTP1Q6DN14 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MCTP1Q6DN14 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MCTP1Q6DN14 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
MCTP1Q6DN14 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MCTP1Q6DN14 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MCTP1Q6DN14 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
MCTP1Q6DN14 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MCTP1Q6DN14 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MCTP1Q6DN14 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MCTP1Q6DN14 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MCTP1Q6DN14 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MCTP1Q6DN14 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
MCTP1Q6DN14 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
MCTP1Q6DN14 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
MCTP1Q6DN14 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
MCTP1Q6DN14 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
MCTP1Q6DN14 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
MCTP1Q6DN14 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
MCTP1Q6DN14 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MCTP1Q6DN14 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MCTP1Q6DN14 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
MCTP1Q6DN14 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MCTP1Q6DN14 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MCTP1Q6DN14 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MCTP1Q6DN14 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MCTP1Q6DN14 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MCTP1Q6DN14 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MCTP1Q6DN14 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MCTP1Q6DN14 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MCTP1Q6DN14 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MCTP1Q6DN14 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MCTP1Q6DN14 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MCTP1Q6DN14 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MCTP1Q6DN14 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MCTP1Q6DN14 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MCTP1Q6DN14 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MCTP1Q6DN14 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MCTP1Q6DN14 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MCTP1Q6DN14 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MCTP1Q6DN14 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MCTP1Q6DN14 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MCTP1Q6DN14 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MCTP1Q6DN14 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MCTP1Q6DN14 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms