Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATL3Q6DD88 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATL3Q6DD88 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATL3Q6DD88 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATL3Q6DD88 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATL3Q6DD88 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATL3Q6DD88 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATL3Q6DD88 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATL3Q6DD88 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
ATL3Q6DD88 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
ATL3Q6DD88 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATL3Q6DD88 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATL3Q6DD88 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATL3Q6DD88 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATL3Q6DD88 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATL3Q6DD88 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATL3Q6DD88 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATL3Q6DD88 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATL3Q6DD88 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATL3Q6DD88 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATL3Q6DD88 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATL3Q6DD88 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATL3Q6DD88 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATL3Q6DD88 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATL3Q6DD88 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATL3Q6DD88 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATL3Q6DD88 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATL3Q6DD88 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATL3Q6DD88 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATL3Q6DD88 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATL3Q6DD88 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATL3Q6DD88 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATL3Q6DD88 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
ATL3Q6DD88 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATL3Q6DD88 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATL3Q6DD88 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATL3Q6DD88 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATL3Q6DD88 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATL3Q6DD88 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATL3Q6DD88 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATL3Q6DD88 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATL3Q6DD88 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
ATL3Q6DD88 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATL3Q6DD88 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATL3Q6DD88 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATL3Q6DD88 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATL3Q6DD88 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATL3Q6DD88 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATL3Q6DD88 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATL3Q6DD88 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATL3Q6DD88 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATL3Q6DD88 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
ATL3Q6DD88 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATL3Q6DD88 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ATL3Q6DD88 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATL3Q6DD88 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATL3Q6DD88 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATL3Q6DD88 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATL3Q6DD88 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATL3Q6DD88 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATL3Q6DD88 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATL3Q6DD88 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATL3Q6DD88 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATL3Q6DD88 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATL3Q6DD88 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATL3Q6DD88 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
ATL3Q6DD88 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATL3Q6DD88 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
ATL3Q6DD88 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATL3Q6DD88 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATL3Q6DD88 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATL3Q6DD88 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATL3Q6DD88 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATL3Q6DD88 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATL3Q6DD88 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATL3Q6DD88 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATL3Q6DD88 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATL3Q6DD88 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATL3Q6DD88 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATL3Q6DD88 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATL3Q6DD88 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATL3Q6DD88 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATL3Q6DD88 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATL3Q6DD88 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATL3Q6DD88 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATL3Q6DD88 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATL3Q6DD88 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATL3Q6DD88 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATL3Q6DD88 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATL3Q6DD88 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATL3Q6DD88 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATL3Q6DD88 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATL3Q6DD88 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATL3Q6DD88 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATL3Q6DD88 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATL3Q6DD88 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATL3Q6DD88 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATL3Q6DD88 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATL3Q6DD88 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATL3Q6DD88 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms