Protein–RNA interactions for Protein: Q6A163

KRT39, Keratin, type I cytoskeletal 39, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT39Q6A163 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT39Q6A163 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT39Q6A163 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT39Q6A163 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT39Q6A163 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT39Q6A163 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT39Q6A163 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT39Q6A163 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT39Q6A163 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT39Q6A163 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT39Q6A163 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT39Q6A163 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KRT39Q6A163 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KRT39Q6A163 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KRT39Q6A163 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KRT39Q6A163 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
KRT39Q6A163 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT39Q6A163 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT39Q6A163 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT39Q6A163 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT39Q6A163 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT39Q6A163 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT39Q6A163 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT39Q6A163 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT39Q6A163 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT39Q6A163 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT39Q6A163 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT39Q6A163 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT39Q6A163 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT39Q6A163 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT39Q6A163 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT39Q6A163 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT39Q6A163 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT39Q6A163 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT39Q6A163 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT39Q6A163 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT39Q6A163 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT39Q6A163 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT39Q6A163 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT39Q6A163 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT39Q6A163 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT39Q6A163 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT39Q6A163 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT39Q6A163 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KRT39Q6A163 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KRT39Q6A163 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KRT39Q6A163 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT39Q6A163 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT39Q6A163 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT39Q6A163 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT39Q6A163 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT39Q6A163 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT39Q6A163 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT39Q6A163 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT39Q6A163 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT39Q6A163 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT39Q6A163 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT39Q6A163 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT39Q6A163 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT39Q6A163 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT39Q6A163 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT39Q6A163 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT39Q6A163 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT39Q6A163 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT39Q6A163 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT39Q6A163 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT39Q6A163 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT39Q6A163 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT39Q6A163 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT39Q6A163 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT39Q6A163 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT39Q6A163 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT39Q6A163 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT39Q6A163 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT39Q6A163 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT39Q6A163 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT39Q6A163 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT39Q6A163 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT39Q6A163 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT39Q6A163 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT39Q6A163 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT39Q6A163 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT39Q6A163 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT39Q6A163 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT39Q6A163 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT39Q6A163 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT39Q6A163 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT39Q6A163 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT39Q6A163 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT39Q6A163 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT39Q6A163 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT39Q6A163 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT39Q6A163 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT39Q6A163 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT39Q6A163 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
KRT39Q6A163 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT39Q6A163 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRT39Q6A163 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
KRT39Q6A163 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.54■■■□□ 2
KRT39Q6A163 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms