Protein–RNA interactions for Protein: Q66K89

E4F1, Transcription factor E4F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4F1Q66K89 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
E4F1Q66K89 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
E4F1Q66K89 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
E4F1Q66K89 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
E4F1Q66K89 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
E4F1Q66K89 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
E4F1Q66K89 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
E4F1Q66K89 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
E4F1Q66K89 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
E4F1Q66K89 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
E4F1Q66K89 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
E4F1Q66K89 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
E4F1Q66K89 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
E4F1Q66K89 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
E4F1Q66K89 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
E4F1Q66K89 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
E4F1Q66K89 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
E4F1Q66K89 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
E4F1Q66K89 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
E4F1Q66K89 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
E4F1Q66K89 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
E4F1Q66K89 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
E4F1Q66K89 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
E4F1Q66K89 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
E4F1Q66K89 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
E4F1Q66K89 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
E4F1Q66K89 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
E4F1Q66K89 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
E4F1Q66K89 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
E4F1Q66K89 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
E4F1Q66K89 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
E4F1Q66K89 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
E4F1Q66K89 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
E4F1Q66K89 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
E4F1Q66K89 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
E4F1Q66K89 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
E4F1Q66K89 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
E4F1Q66K89 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
E4F1Q66K89 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
E4F1Q66K89 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
E4F1Q66K89 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
E4F1Q66K89 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
E4F1Q66K89 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
E4F1Q66K89 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
E4F1Q66K89 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
E4F1Q66K89 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
E4F1Q66K89 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
E4F1Q66K89 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
E4F1Q66K89 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
E4F1Q66K89 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
E4F1Q66K89 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
E4F1Q66K89 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
E4F1Q66K89 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
E4F1Q66K89 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
E4F1Q66K89 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
E4F1Q66K89 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
E4F1Q66K89 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
E4F1Q66K89 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
E4F1Q66K89 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
E4F1Q66K89 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
E4F1Q66K89 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
E4F1Q66K89 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
E4F1Q66K89 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
E4F1Q66K89 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
E4F1Q66K89 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
E4F1Q66K89 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
E4F1Q66K89 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
E4F1Q66K89 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
E4F1Q66K89 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
E4F1Q66K89 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
E4F1Q66K89 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
E4F1Q66K89 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
E4F1Q66K89 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
E4F1Q66K89 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
E4F1Q66K89 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
E4F1Q66K89 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
E4F1Q66K89 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
E4F1Q66K89 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
E4F1Q66K89 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
E4F1Q66K89 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
E4F1Q66K89 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
E4F1Q66K89 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
E4F1Q66K89 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
E4F1Q66K89 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
E4F1Q66K89 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
E4F1Q66K89 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
E4F1Q66K89 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
E4F1Q66K89 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
E4F1Q66K89 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
E4F1Q66K89 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
E4F1Q66K89 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
E4F1Q66K89 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
E4F1Q66K89 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
E4F1Q66K89 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
E4F1Q66K89 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
E4F1Q66K89 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
E4F1Q66K89 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
E4F1Q66K89 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
E4F1Q66K89 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
E4F1Q66K89 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms