Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSP4

LCN1P1, Putative lipocalin 1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN1P1Q5VSP4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LCN1P1Q5VSP4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LCN1P1Q5VSP4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LCN1P1Q5VSP4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCN1P1Q5VSP4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCN1P1Q5VSP4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCN1P1Q5VSP4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCN1P1Q5VSP4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LCN1P1Q5VSP4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCN1P1Q5VSP4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCN1P1Q5VSP4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCN1P1Q5VSP4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCN1P1Q5VSP4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCN1P1Q5VSP4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCN1P1Q5VSP4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCN1P1Q5VSP4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCN1P1Q5VSP4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCN1P1Q5VSP4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCN1P1Q5VSP4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCN1P1Q5VSP4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCN1P1Q5VSP4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCN1P1Q5VSP4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCN1P1Q5VSP4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCN1P1Q5VSP4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCN1P1Q5VSP4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LCN1P1Q5VSP4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCN1P1Q5VSP4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCN1P1Q5VSP4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCN1P1Q5VSP4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCN1P1Q5VSP4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCN1P1Q5VSP4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCN1P1Q5VSP4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCN1P1Q5VSP4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCN1P1Q5VSP4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCN1P1Q5VSP4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCN1P1Q5VSP4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LCN1P1Q5VSP4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCN1P1Q5VSP4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCN1P1Q5VSP4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCN1P1Q5VSP4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCN1P1Q5VSP4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCN1P1Q5VSP4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCN1P1Q5VSP4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCN1P1Q5VSP4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCN1P1Q5VSP4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCN1P1Q5VSP4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCN1P1Q5VSP4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCN1P1Q5VSP4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCN1P1Q5VSP4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCN1P1Q5VSP4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCN1P1Q5VSP4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LCN1P1Q5VSP4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LCN1P1Q5VSP4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LCN1P1Q5VSP4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LCN1P1Q5VSP4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCN1P1Q5VSP4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCN1P1Q5VSP4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCN1P1Q5VSP4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCN1P1Q5VSP4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCN1P1Q5VSP4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCN1P1Q5VSP4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCN1P1Q5VSP4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCN1P1Q5VSP4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCN1P1Q5VSP4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCN1P1Q5VSP4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCN1P1Q5VSP4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCN1P1Q5VSP4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCN1P1Q5VSP4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCN1P1Q5VSP4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCN1P1Q5VSP4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCN1P1Q5VSP4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCN1P1Q5VSP4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCN1P1Q5VSP4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCN1P1Q5VSP4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCN1P1Q5VSP4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCN1P1Q5VSP4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCN1P1Q5VSP4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LCN1P1Q5VSP4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LCN1P1Q5VSP4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LCN1P1Q5VSP4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LCN1P1Q5VSP4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCN1P1Q5VSP4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCN1P1Q5VSP4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCN1P1Q5VSP4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCN1P1Q5VSP4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCN1P1Q5VSP4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCN1P1Q5VSP4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCN1P1Q5VSP4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCN1P1Q5VSP4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCN1P1Q5VSP4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCN1P1Q5VSP4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCN1P1Q5VSP4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LCN1P1Q5VSP4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCN1P1Q5VSP4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCN1P1Q5VSP4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCN1P1Q5VSP4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LCN1P1Q5VSP4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCN1P1Q5VSP4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCN1P1Q5VSP4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCN1P1Q5VSP4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms