Protein–RNA interactions for Protein: Q53H54

TRMT12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT12Q53H54 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRMT12Q53H54 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRMT12Q53H54 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRMT12Q53H54 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRMT12Q53H54 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRMT12Q53H54 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TRMT12Q53H54 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRMT12Q53H54 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRMT12Q53H54 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRMT12Q53H54 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRMT12Q53H54 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRMT12Q53H54 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRMT12Q53H54 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TRMT12Q53H54 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRMT12Q53H54 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRMT12Q53H54 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRMT12Q53H54 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRMT12Q53H54 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRMT12Q53H54 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRMT12Q53H54 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRMT12Q53H54 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRMT12Q53H54 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRMT12Q53H54 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRMT12Q53H54 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRMT12Q53H54 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRMT12Q53H54 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRMT12Q53H54 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRMT12Q53H54 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRMT12Q53H54 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRMT12Q53H54 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRMT12Q53H54 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRMT12Q53H54 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRMT12Q53H54 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRMT12Q53H54 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRMT12Q53H54 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRMT12Q53H54 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRMT12Q53H54 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRMT12Q53H54 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRMT12Q53H54 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRMT12Q53H54 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRMT12Q53H54 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRMT12Q53H54 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRMT12Q53H54 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRMT12Q53H54 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRMT12Q53H54 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRMT12Q53H54 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRMT12Q53H54 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRMT12Q53H54 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRMT12Q53H54 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRMT12Q53H54 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRMT12Q53H54 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRMT12Q53H54 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRMT12Q53H54 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRMT12Q53H54 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRMT12Q53H54 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRMT12Q53H54 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRMT12Q53H54 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRMT12Q53H54 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRMT12Q53H54 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRMT12Q53H54 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRMT12Q53H54 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRMT12Q53H54 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRMT12Q53H54 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRMT12Q53H54 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRMT12Q53H54 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRMT12Q53H54 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRMT12Q53H54 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRMT12Q53H54 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TRMT12Q53H54 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRMT12Q53H54 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRMT12Q53H54 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRMT12Q53H54 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRMT12Q53H54 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRMT12Q53H54 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRMT12Q53H54 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRMT12Q53H54 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRMT12Q53H54 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRMT12Q53H54 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRMT12Q53H54 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRMT12Q53H54 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRMT12Q53H54 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TRMT12Q53H54 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRMT12Q53H54 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRMT12Q53H54 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRMT12Q53H54 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRMT12Q53H54 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRMT12Q53H54 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRMT12Q53H54 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRMT12Q53H54 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TRMT12Q53H54 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TRMT12Q53H54 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRMT12Q53H54 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRMT12Q53H54 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRMT12Q53H54 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRMT12Q53H54 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRMT12Q53H54 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRMT12Q53H54 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRMT12Q53H54 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRMT12Q53H54 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRMT12Q53H54 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms