Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSD17B12Q53GQ0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSD17B12Q53GQ0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HSD17B12Q53GQ0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSD17B12Q53GQ0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSD17B12Q53GQ0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSD17B12Q53GQ0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSD17B12Q53GQ0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSD17B12Q53GQ0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSD17B12Q53GQ0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSD17B12Q53GQ0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSD17B12Q53GQ0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSD17B12Q53GQ0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSD17B12Q53GQ0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSD17B12Q53GQ0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HSD17B12Q53GQ0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSD17B12Q53GQ0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSD17B12Q53GQ0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSD17B12Q53GQ0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSD17B12Q53GQ0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSD17B12Q53GQ0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSD17B12Q53GQ0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSD17B12Q53GQ0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSD17B12Q53GQ0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSD17B12Q53GQ0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSD17B12Q53GQ0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSD17B12Q53GQ0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSD17B12Q53GQ0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSD17B12Q53GQ0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSD17B12Q53GQ0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSD17B12Q53GQ0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSD17B12Q53GQ0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HSD17B12Q53GQ0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSD17B12Q53GQ0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSD17B12Q53GQ0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSD17B12Q53GQ0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSD17B12Q53GQ0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSD17B12Q53GQ0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSD17B12Q53GQ0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSD17B12Q53GQ0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSD17B12Q53GQ0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSD17B12Q53GQ0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSD17B12Q53GQ0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSD17B12Q53GQ0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSD17B12Q53GQ0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSD17B12Q53GQ0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSD17B12Q53GQ0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSD17B12Q53GQ0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSD17B12Q53GQ0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSD17B12Q53GQ0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSD17B12Q53GQ0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSD17B12Q53GQ0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSD17B12Q53GQ0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSD17B12Q53GQ0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSD17B12Q53GQ0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSD17B12Q53GQ0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSD17B12Q53GQ0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSD17B12Q53GQ0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSD17B12Q53GQ0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSD17B12Q53GQ0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSD17B12Q53GQ0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSD17B12Q53GQ0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSD17B12Q53GQ0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSD17B12Q53GQ0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSD17B12Q53GQ0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSD17B12Q53GQ0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSD17B12Q53GQ0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSD17B12Q53GQ0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSD17B12Q53GQ0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSD17B12Q53GQ0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSD17B12Q53GQ0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSD17B12Q53GQ0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HSD17B12Q53GQ0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSD17B12Q53GQ0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSD17B12Q53GQ0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSD17B12Q53GQ0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSD17B12Q53GQ0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HSD17B12Q53GQ0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HSD17B12Q53GQ0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HSD17B12Q53GQ0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HSD17B12Q53GQ0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HSD17B12Q53GQ0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HSD17B12Q53GQ0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HSD17B12Q53GQ0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HSD17B12Q53GQ0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HSD17B12Q53GQ0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HSD17B12Q53GQ0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HSD17B12Q53GQ0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HSD17B12Q53GQ0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HSD17B12Q53GQ0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HSD17B12Q53GQ0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
HSD17B12Q53GQ0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HSD17B12Q53GQ0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HSD17B12Q53GQ0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HSD17B12Q53GQ0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HSD17B12Q53GQ0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HSD17B12Q53GQ0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HSD17B12Q53GQ0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms