Protein–RNA interactions for Protein: Q53GD3

SLC44A4, Choline transporter-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A4Q53GD3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC44A4Q53GD3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLC44A4Q53GD3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC44A4Q53GD3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC44A4Q53GD3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC44A4Q53GD3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC44A4Q53GD3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC44A4Q53GD3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC44A4Q53GD3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC44A4Q53GD3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC44A4Q53GD3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC44A4Q53GD3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC44A4Q53GD3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC44A4Q53GD3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC44A4Q53GD3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC44A4Q53GD3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC44A4Q53GD3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC44A4Q53GD3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC44A4Q53GD3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC44A4Q53GD3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC44A4Q53GD3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC44A4Q53GD3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC44A4Q53GD3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC44A4Q53GD3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC44A4Q53GD3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC44A4Q53GD3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC44A4Q53GD3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC44A4Q53GD3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC44A4Q53GD3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC44A4Q53GD3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC44A4Q53GD3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC44A4Q53GD3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC44A4Q53GD3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC44A4Q53GD3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC44A4Q53GD3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC44A4Q53GD3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC44A4Q53GD3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC44A4Q53GD3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC44A4Q53GD3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC44A4Q53GD3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC44A4Q53GD3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC44A4Q53GD3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC44A4Q53GD3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC44A4Q53GD3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC44A4Q53GD3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC44A4Q53GD3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC44A4Q53GD3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC44A4Q53GD3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC44A4Q53GD3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC44A4Q53GD3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC44A4Q53GD3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC44A4Q53GD3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC44A4Q53GD3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC44A4Q53GD3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC44A4Q53GD3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC44A4Q53GD3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC44A4Q53GD3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC44A4Q53GD3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC44A4Q53GD3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC44A4Q53GD3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC44A4Q53GD3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC44A4Q53GD3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC44A4Q53GD3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC44A4Q53GD3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC44A4Q53GD3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC44A4Q53GD3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC44A4Q53GD3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC44A4Q53GD3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC44A4Q53GD3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC44A4Q53GD3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC44A4Q53GD3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC44A4Q53GD3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC44A4Q53GD3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC44A4Q53GD3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC44A4Q53GD3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC44A4Q53GD3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC44A4Q53GD3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC44A4Q53GD3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC44A4Q53GD3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC44A4Q53GD3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC44A4Q53GD3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC44A4Q53GD3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC44A4Q53GD3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC44A4Q53GD3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC44A4Q53GD3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC44A4Q53GD3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLC44A4Q53GD3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLC44A4Q53GD3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
SLC44A4Q53GD3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC44A4Q53GD3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC44A4Q53GD3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC44A4Q53GD3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC44A4Q53GD3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC44A4Q53GD3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC44A4Q53GD3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC44A4Q53GD3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC44A4Q53GD3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC44A4Q53GD3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC44A4Q53GD3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC44A4Q53GD3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms