Protein–RNA interactions for Protein: Q494X3

ZNF404, Zinc finger protein 404, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF404Q494X3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF404Q494X3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF404Q494X3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF404Q494X3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF404Q494X3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF404Q494X3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF404Q494X3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF404Q494X3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF404Q494X3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF404Q494X3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF404Q494X3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF404Q494X3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF404Q494X3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF404Q494X3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF404Q494X3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF404Q494X3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF404Q494X3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF404Q494X3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF404Q494X3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF404Q494X3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF404Q494X3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF404Q494X3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF404Q494X3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF404Q494X3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF404Q494X3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF404Q494X3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF404Q494X3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF404Q494X3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF404Q494X3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF404Q494X3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF404Q494X3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF404Q494X3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF404Q494X3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF404Q494X3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF404Q494X3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF404Q494X3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF404Q494X3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF404Q494X3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF404Q494X3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF404Q494X3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF404Q494X3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF404Q494X3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF404Q494X3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF404Q494X3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF404Q494X3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF404Q494X3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF404Q494X3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF404Q494X3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF404Q494X3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF404Q494X3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF404Q494X3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF404Q494X3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF404Q494X3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF404Q494X3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF404Q494X3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF404Q494X3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF404Q494X3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF404Q494X3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF404Q494X3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF404Q494X3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF404Q494X3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF404Q494X3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF404Q494X3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF404Q494X3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF404Q494X3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF404Q494X3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF404Q494X3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF404Q494X3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF404Q494X3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF404Q494X3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF404Q494X3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF404Q494X3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF404Q494X3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF404Q494X3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF404Q494X3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF404Q494X3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF404Q494X3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF404Q494X3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF404Q494X3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF404Q494X3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF404Q494X3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF404Q494X3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF404Q494X3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF404Q494X3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF404Q494X3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF404Q494X3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF404Q494X3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF404Q494X3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF404Q494X3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF404Q494X3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF404Q494X3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF404Q494X3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF404Q494X3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF404Q494X3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF404Q494X3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF404Q494X3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF404Q494X3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF404Q494X3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF404Q494X3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF404Q494X3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms