Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLHL38Q2WGJ6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLHL38Q2WGJ6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLHL38Q2WGJ6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLHL38Q2WGJ6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHL38Q2WGJ6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHL38Q2WGJ6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHL38Q2WGJ6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHL38Q2WGJ6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KLHL38Q2WGJ6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KLHL38Q2WGJ6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KLHL38Q2WGJ6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KLHL38Q2WGJ6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KLHL38Q2WGJ6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KLHL38Q2WGJ6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KLHL38Q2WGJ6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KLHL38Q2WGJ6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
KLHL38Q2WGJ6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KLHL38Q2WGJ6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KLHL38Q2WGJ6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KLHL38Q2WGJ6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KLHL38Q2WGJ6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KLHL38Q2WGJ6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KLHL38Q2WGJ6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KLHL38Q2WGJ6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KLHL38Q2WGJ6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KLHL38Q2WGJ6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KLHL38Q2WGJ6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KLHL38Q2WGJ6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KLHL38Q2WGJ6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KLHL38Q2WGJ6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KLHL38Q2WGJ6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KLHL38Q2WGJ6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL38Q2WGJ6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL38Q2WGJ6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL38Q2WGJ6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL38Q2WGJ6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KLHL38Q2WGJ6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KLHL38Q2WGJ6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KLHL38Q2WGJ6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KLHL38Q2WGJ6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KLHL38Q2WGJ6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KLHL38Q2WGJ6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KLHL38Q2WGJ6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KLHL38Q2WGJ6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KLHL38Q2WGJ6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHL38Q2WGJ6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHL38Q2WGJ6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHL38Q2WGJ6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHL38Q2WGJ6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHL38Q2WGJ6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHL38Q2WGJ6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHL38Q2WGJ6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHL38Q2WGJ6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHL38Q2WGJ6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHL38Q2WGJ6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHL38Q2WGJ6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL38Q2WGJ6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL38Q2WGJ6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL38Q2WGJ6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL38Q2WGJ6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL38Q2WGJ6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL38Q2WGJ6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHL38Q2WGJ6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHL38Q2WGJ6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHL38Q2WGJ6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHL38Q2WGJ6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHL38Q2WGJ6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHL38Q2WGJ6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHL38Q2WGJ6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
KLHL38Q2WGJ6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
KLHL38Q2WGJ6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHL38Q2WGJ6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHL38Q2WGJ6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHL38Q2WGJ6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHL38Q2WGJ6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHL38Q2WGJ6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHL38Q2WGJ6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHL38Q2WGJ6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHL38Q2WGJ6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHL38Q2WGJ6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHL38Q2WGJ6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHL38Q2WGJ6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHL38Q2WGJ6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHL38Q2WGJ6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLHL38Q2WGJ6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLHL38Q2WGJ6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLHL38Q2WGJ6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KLHL38Q2WGJ6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KLHL38Q2WGJ6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KLHL38Q2WGJ6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KLHL38Q2WGJ6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
KLHL38Q2WGJ6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KLHL38Q2WGJ6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KLHL38Q2WGJ6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KLHL38Q2WGJ6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KLHL38Q2WGJ6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KLHL38Q2WGJ6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KLHL38Q2WGJ6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KLHL38Q2WGJ6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms