Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ISXQ2M1V0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ISXQ2M1V0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ISXQ2M1V0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ISXQ2M1V0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ISXQ2M1V0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ISXQ2M1V0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ISXQ2M1V0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ISXQ2M1V0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ISXQ2M1V0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ISXQ2M1V0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ISXQ2M1V0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ISXQ2M1V0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ISXQ2M1V0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ISXQ2M1V0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ISXQ2M1V0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ISXQ2M1V0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ISXQ2M1V0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ISXQ2M1V0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ISXQ2M1V0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ISXQ2M1V0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ISXQ2M1V0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ISXQ2M1V0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ISXQ2M1V0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ISXQ2M1V0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ISXQ2M1V0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ISXQ2M1V0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ISXQ2M1V0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ISXQ2M1V0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ISXQ2M1V0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ISXQ2M1V0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ISXQ2M1V0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ISXQ2M1V0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ISXQ2M1V0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ISXQ2M1V0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ISXQ2M1V0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ISXQ2M1V0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ISXQ2M1V0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ISXQ2M1V0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ISXQ2M1V0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ISXQ2M1V0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ISXQ2M1V0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ISXQ2M1V0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ISXQ2M1V0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ISXQ2M1V0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ISXQ2M1V0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ISXQ2M1V0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ISXQ2M1V0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ISXQ2M1V0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ISXQ2M1V0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ISXQ2M1V0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ISXQ2M1V0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ISXQ2M1V0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ISXQ2M1V0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ISXQ2M1V0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ISXQ2M1V0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ISXQ2M1V0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ISXQ2M1V0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ISXQ2M1V0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ISXQ2M1V0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ISXQ2M1V0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ISXQ2M1V0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ISXQ2M1V0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ISXQ2M1V0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ISXQ2M1V0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ISXQ2M1V0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ISXQ2M1V0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ISXQ2M1V0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ISXQ2M1V0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ISXQ2M1V0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ISXQ2M1V0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ISXQ2M1V0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ISXQ2M1V0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ISXQ2M1V0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ISXQ2M1V0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ISXQ2M1V0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ISXQ2M1V0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ISXQ2M1V0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ISXQ2M1V0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ISXQ2M1V0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ISXQ2M1V0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ISXQ2M1V0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
ISXQ2M1V0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ISXQ2M1V0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ISXQ2M1V0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ISXQ2M1V0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ISXQ2M1V0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ISXQ2M1V0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ISXQ2M1V0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ISXQ2M1V0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ISXQ2M1V0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ISXQ2M1V0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ISXQ2M1V0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ISXQ2M1V0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ISXQ2M1V0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ISXQ2M1V0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ISXQ2M1V0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ISXQ2M1V0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ISXQ2M1V0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ISXQ2M1V0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.6 ms