Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HIF1AQ16665 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HIF1AQ16665 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HIF1AQ16665 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HIF1AQ16665 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HIF1AQ16665 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HIF1AQ16665 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HIF1AQ16665 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HIF1AQ16665 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HIF1AQ16665 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HIF1AQ16665 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HIF1AQ16665 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HIF1AQ16665 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HIF1AQ16665 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HIF1AQ16665 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HIF1AQ16665 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HIF1AQ16665 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HIF1AQ16665 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIF1AQ16665 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIF1AQ16665 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIF1AQ16665 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIF1AQ16665 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIF1AQ16665 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIF1AQ16665 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIF1AQ16665 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIF1AQ16665 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HIF1AQ16665 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HIF1AQ16665 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HIF1AQ16665 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HIF1AQ16665 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
HIF1AQ16665 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
HIF1AQ16665 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIF1AQ16665 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIF1AQ16665 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIF1AQ16665 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIF1AQ16665 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIF1AQ16665 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIF1AQ16665 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIF1AQ16665 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HIF1AQ16665 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HIF1AQ16665 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HIF1AQ16665 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
HIF1AQ16665 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HIF1AQ16665 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HIF1AQ16665 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HIF1AQ16665 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HIF1AQ16665 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HIF1AQ16665 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HIF1AQ16665 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HIF1AQ16665 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HIF1AQ16665 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HIF1AQ16665 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HIF1AQ16665 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HIF1AQ16665 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HIF1AQ16665 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HIF1AQ16665 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HIF1AQ16665 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HIF1AQ16665 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HIF1AQ16665 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HIF1AQ16665 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HIF1AQ16665 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HIF1AQ16665 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HIF1AQ16665 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HIF1AQ16665 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HIF1AQ16665 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HIF1AQ16665 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HIF1AQ16665 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HIF1AQ16665 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HIF1AQ16665 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HIF1AQ16665 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HIF1AQ16665 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HIF1AQ16665 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HIF1AQ16665 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HIF1AQ16665 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HIF1AQ16665 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HIF1AQ16665 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HIF1AQ16665 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HIF1AQ16665 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HIF1AQ16665 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HIF1AQ16665 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HIF1AQ16665 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HIF1AQ16665 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HIF1AQ16665 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HIF1AQ16665 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HIF1AQ16665 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HIF1AQ16665 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HIF1AQ16665 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HIF1AQ16665 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
HIF1AQ16665 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HIF1AQ16665 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HIF1AQ16665 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HIF1AQ16665 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HIF1AQ16665 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HIF1AQ16665 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HIF1AQ16665 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HIF1AQ16665 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HIF1AQ16665 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HIF1AQ16665 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HIF1AQ16665 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HIF1AQ16665 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
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