Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TNXAQ16473 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TNXAQ16473 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TNXAQ16473 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TNXAQ16473 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TNXAQ16473 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNXAQ16473 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNXAQ16473 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNXAQ16473 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNXAQ16473 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNXAQ16473 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TNXAQ16473 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNXAQ16473 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNXAQ16473 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNXAQ16473 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TNXAQ16473 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNXAQ16473 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNXAQ16473 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNXAQ16473 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNXAQ16473 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNXAQ16473 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNXAQ16473 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNXAQ16473 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNXAQ16473 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNXAQ16473 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNXAQ16473 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNXAQ16473 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNXAQ16473 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TNXAQ16473 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNXAQ16473 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNXAQ16473 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNXAQ16473 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNXAQ16473 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNXAQ16473 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNXAQ16473 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNXAQ16473 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNXAQ16473 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNXAQ16473 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNXAQ16473 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNXAQ16473 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TNXAQ16473 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNXAQ16473 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNXAQ16473 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNXAQ16473 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNXAQ16473 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNXAQ16473 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNXAQ16473 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNXAQ16473 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNXAQ16473 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNXAQ16473 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNXAQ16473 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNXAQ16473 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNXAQ16473 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TNXAQ16473 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNXAQ16473 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNXAQ16473 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNXAQ16473 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNXAQ16473 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNXAQ16473 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNXAQ16473 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNXAQ16473 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNXAQ16473 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNXAQ16473 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNXAQ16473 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNXAQ16473 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNXAQ16473 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNXAQ16473 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNXAQ16473 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNXAQ16473 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNXAQ16473 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNXAQ16473 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNXAQ16473 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNXAQ16473 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNXAQ16473 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNXAQ16473 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNXAQ16473 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNXAQ16473 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNXAQ16473 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNXAQ16473 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TNXAQ16473 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNXAQ16473 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNXAQ16473 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNXAQ16473 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNXAQ16473 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNXAQ16473 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNXAQ16473 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNXAQ16473 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNXAQ16473 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNXAQ16473 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TNXAQ16473 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNXAQ16473 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNXAQ16473 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TNXAQ16473 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TNXAQ16473 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TNXAQ16473 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TNXAQ16473 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TNXAQ16473 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
TNXAQ16473 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TNXAQ16473 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNXAQ16473 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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