Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SS18Q15532 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SS18Q15532 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SS18Q15532 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SS18Q15532 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SS18Q15532 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SS18Q15532 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SS18Q15532 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SS18Q15532 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SS18Q15532 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SS18Q15532 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SS18Q15532 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SS18Q15532 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SS18Q15532 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SS18Q15532 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SS18Q15532 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SS18Q15532 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SS18Q15532 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SS18Q15532 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SS18Q15532 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SS18Q15532 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SS18Q15532 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SS18Q15532 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SS18Q15532 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SS18Q15532 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SS18Q15532 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SS18Q15532 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SS18Q15532 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SS18Q15532 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SS18Q15532 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SS18Q15532 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SS18Q15532 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SS18Q15532 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SS18Q15532 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SS18Q15532 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SS18Q15532 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SS18Q15532 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SS18Q15532 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SS18Q15532 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SS18Q15532 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SS18Q15532 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SS18Q15532 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SS18Q15532 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SS18Q15532 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SS18Q15532 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SS18Q15532 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SS18Q15532 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SS18Q15532 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SS18Q15532 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SS18Q15532 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SS18Q15532 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SS18Q15532 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SS18Q15532 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SS18Q15532 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SS18Q15532 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SS18Q15532 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SS18Q15532 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SS18Q15532 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SS18Q15532 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SS18Q15532 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SS18Q15532 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SS18Q15532 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SS18Q15532 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SS18Q15532 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SS18Q15532 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SS18Q15532 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SS18Q15532 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SS18Q15532 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SS18Q15532 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SS18Q15532 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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SS18Q15532 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SS18Q15532 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SS18Q15532 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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SS18Q15532 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SS18Q15532 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SS18Q15532 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SS18Q15532 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SS18Q15532 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SS18Q15532 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SS18Q15532 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SS18Q15532 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SS18Q15532 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SS18Q15532 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SS18Q15532 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SS18Q15532 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SS18Q15532 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SS18Q15532 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SS18Q15532 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SS18Q15532 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SS18Q15532 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SS18Q15532 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SS18Q15532 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SS18Q15532 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SS18Q15532 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SS18Q15532 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SS18Q15532 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SS18Q15532 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SS18Q15532 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms