Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRRQ15256 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRRQ15256 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRRQ15256 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRRQ15256 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRRQ15256 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRRQ15256 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRRQ15256 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRRQ15256 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRRQ15256 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRRQ15256 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRRQ15256 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRRQ15256 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRRQ15256 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRRQ15256 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRRQ15256 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRRQ15256 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRRQ15256 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRRQ15256 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRRQ15256 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRRQ15256 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRRQ15256 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRRQ15256 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRRQ15256 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRRQ15256 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRRQ15256 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRRQ15256 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRRQ15256 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRRQ15256 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRRQ15256 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRRQ15256 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRRQ15256 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRRQ15256 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRRQ15256 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRRQ15256 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRRQ15256 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRRQ15256 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRRQ15256 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRRQ15256 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRRQ15256 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRRQ15256 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRRQ15256 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRRQ15256 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRRQ15256 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PTPRRQ15256 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRRQ15256 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRRQ15256 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRRQ15256 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRRQ15256 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRRQ15256 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRRQ15256 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRRQ15256 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRRQ15256 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRRQ15256 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRRQ15256 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRRQ15256 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRRQ15256 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRRQ15256 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRRQ15256 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRRQ15256 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRRQ15256 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRRQ15256 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRRQ15256 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRRQ15256 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRRQ15256 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRRQ15256 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRRQ15256 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRRQ15256 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRRQ15256 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRRQ15256 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRRQ15256 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRRQ15256 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRRQ15256 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTPRRQ15256 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRRQ15256 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRRQ15256 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRRQ15256 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRRQ15256 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRRQ15256 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRRQ15256 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRRQ15256 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRRQ15256 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRRQ15256 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRRQ15256 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRRQ15256 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRRQ15256 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRRQ15256 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRRQ15256 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRRQ15256 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRRQ15256 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRRQ15256 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRRQ15256 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRRQ15256 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRRQ15256 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRRQ15256 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRRQ15256 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRRQ15256 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRRQ15256 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRRQ15256 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRRQ15256 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms