Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERPUD1Q15011 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERPUD1Q15011 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERPUD1Q15011 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERPUD1Q15011 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERPUD1Q15011 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HERPUD1Q15011 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HERPUD1Q15011 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERPUD1Q15011 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERPUD1Q15011 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERPUD1Q15011 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERPUD1Q15011 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERPUD1Q15011 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERPUD1Q15011 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERPUD1Q15011 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERPUD1Q15011 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERPUD1Q15011 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERPUD1Q15011 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERPUD1Q15011 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERPUD1Q15011 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERPUD1Q15011 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERPUD1Q15011 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERPUD1Q15011 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HERPUD1Q15011 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERPUD1Q15011 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERPUD1Q15011 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERPUD1Q15011 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERPUD1Q15011 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERPUD1Q15011 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERPUD1Q15011 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERPUD1Q15011 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERPUD1Q15011 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERPUD1Q15011 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERPUD1Q15011 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERPUD1Q15011 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERPUD1Q15011 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERPUD1Q15011 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERPUD1Q15011 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERPUD1Q15011 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERPUD1Q15011 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERPUD1Q15011 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERPUD1Q15011 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERPUD1Q15011 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERPUD1Q15011 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERPUD1Q15011 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERPUD1Q15011 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERPUD1Q15011 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HERPUD1Q15011 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERPUD1Q15011 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HERPUD1Q15011 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERPUD1Q15011 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERPUD1Q15011 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERPUD1Q15011 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERPUD1Q15011 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERPUD1Q15011 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERPUD1Q15011 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERPUD1Q15011 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERPUD1Q15011 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERPUD1Q15011 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERPUD1Q15011 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERPUD1Q15011 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERPUD1Q15011 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERPUD1Q15011 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HERPUD1Q15011 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HERPUD1Q15011 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HERPUD1Q15011 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERPUD1Q15011 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERPUD1Q15011 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HERPUD1Q15011 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERPUD1Q15011 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HERPUD1Q15011 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERPUD1Q15011 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HERPUD1Q15011 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HERPUD1Q15011 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HERPUD1Q15011 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERPUD1Q15011 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERPUD1Q15011 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERPUD1Q15011 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HERPUD1Q15011 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERPUD1Q15011 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HERPUD1Q15011 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERPUD1Q15011 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HERPUD1Q15011 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERPUD1Q15011 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
HERPUD1Q15011 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERPUD1Q15011 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERPUD1Q15011 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERPUD1Q15011 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HERPUD1Q15011 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERPUD1Q15011 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERPUD1Q15011 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HERPUD1Q15011 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERPUD1Q15011 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERPUD1Q15011 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HERPUD1Q15011 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERPUD1Q15011 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERPUD1Q15011 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HERPUD1Q15011 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERPUD1Q15011 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERPUD1Q15011 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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