Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCLAFQ15004 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PCLAFQ15004 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCLAFQ15004 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCLAFQ15004 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCLAFQ15004 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCLAFQ15004 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCLAFQ15004 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCLAFQ15004 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCLAFQ15004 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCLAFQ15004 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCLAFQ15004 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCLAFQ15004 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCLAFQ15004 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCLAFQ15004 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCLAFQ15004 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCLAFQ15004 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCLAFQ15004 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCLAFQ15004 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCLAFQ15004 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PCLAFQ15004 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCLAFQ15004 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCLAFQ15004 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCLAFQ15004 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCLAFQ15004 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCLAFQ15004 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCLAFQ15004 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCLAFQ15004 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCLAFQ15004 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PCLAFQ15004 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCLAFQ15004 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCLAFQ15004 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCLAFQ15004 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCLAFQ15004 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCLAFQ15004 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCLAFQ15004 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCLAFQ15004 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCLAFQ15004 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCLAFQ15004 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PCLAFQ15004 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCLAFQ15004 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCLAFQ15004 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCLAFQ15004 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCLAFQ15004 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCLAFQ15004 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCLAFQ15004 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCLAFQ15004 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCLAFQ15004 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCLAFQ15004 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCLAFQ15004 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCLAFQ15004 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCLAFQ15004 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCLAFQ15004 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCLAFQ15004 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCLAFQ15004 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCLAFQ15004 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCLAFQ15004 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PCLAFQ15004 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PCLAFQ15004 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCLAFQ15004 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCLAFQ15004 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCLAFQ15004 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCLAFQ15004 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCLAFQ15004 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCLAFQ15004 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCLAFQ15004 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCLAFQ15004 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCLAFQ15004 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCLAFQ15004 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PCLAFQ15004 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCLAFQ15004 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCLAFQ15004 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCLAFQ15004 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCLAFQ15004 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCLAFQ15004 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCLAFQ15004 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCLAFQ15004 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCLAFQ15004 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCLAFQ15004 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCLAFQ15004 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PCLAFQ15004 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCLAFQ15004 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCLAFQ15004 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCLAFQ15004 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PCLAFQ15004 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCLAFQ15004 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCLAFQ15004 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCLAFQ15004 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCLAFQ15004 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCLAFQ15004 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCLAFQ15004 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCLAFQ15004 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCLAFQ15004 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCLAFQ15004 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCLAFQ15004 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCLAFQ15004 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCLAFQ15004 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCLAFQ15004 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCLAFQ15004 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCLAFQ15004 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
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