Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RFTN1Q14699 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RFTN1Q14699 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RFTN1Q14699 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RFTN1Q14699 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RFTN1Q14699 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RFTN1Q14699 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RFTN1Q14699 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RFTN1Q14699 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RFTN1Q14699 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RFTN1Q14699 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RFTN1Q14699 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RFTN1Q14699 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RFTN1Q14699 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RFTN1Q14699 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RFTN1Q14699 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RFTN1Q14699 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RFTN1Q14699 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RFTN1Q14699 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RFTN1Q14699 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RFTN1Q14699 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RFTN1Q14699 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RFTN1Q14699 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RFTN1Q14699 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RFTN1Q14699 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RFTN1Q14699 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RFTN1Q14699 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RFTN1Q14699 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RFTN1Q14699 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RFTN1Q14699 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RFTN1Q14699 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RFTN1Q14699 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RFTN1Q14699 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RFTN1Q14699 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RFTN1Q14699 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RFTN1Q14699 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RFTN1Q14699 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RFTN1Q14699 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RFTN1Q14699 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RFTN1Q14699 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RFTN1Q14699 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RFTN1Q14699 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RFTN1Q14699 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RFTN1Q14699 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RFTN1Q14699 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RFTN1Q14699 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RFTN1Q14699 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RFTN1Q14699 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RFTN1Q14699 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RFTN1Q14699 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RFTN1Q14699 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RFTN1Q14699 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RFTN1Q14699 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RFTN1Q14699 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RFTN1Q14699 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RFTN1Q14699 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RFTN1Q14699 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RFTN1Q14699 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RFTN1Q14699 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RFTN1Q14699 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RFTN1Q14699 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RFTN1Q14699 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RFTN1Q14699 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RFTN1Q14699 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RFTN1Q14699 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RFTN1Q14699 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RFTN1Q14699 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RFTN1Q14699 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RFTN1Q14699 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RFTN1Q14699 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RFTN1Q14699 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RFTN1Q14699 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RFTN1Q14699 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RFTN1Q14699 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RFTN1Q14699 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RFTN1Q14699 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RFTN1Q14699 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RFTN1Q14699 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RFTN1Q14699 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RFTN1Q14699 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RFTN1Q14699 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RFTN1Q14699 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RFTN1Q14699 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RFTN1Q14699 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RFTN1Q14699 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RFTN1Q14699 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RFTN1Q14699 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RFTN1Q14699 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RFTN1Q14699 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RFTN1Q14699 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RFTN1Q14699 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RFTN1Q14699 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RFTN1Q14699 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RFTN1Q14699 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RFTN1Q14699 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RFTN1Q14699 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RFTN1Q14699 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RFTN1Q14699 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RFTN1Q14699 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RFTN1Q14699 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
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