Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUNX3Q13761 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
RUNX3Q13761 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUNX3Q13761 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUNX3Q13761 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RUNX3Q13761 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RUNX3Q13761 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RUNX3Q13761 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RUNX3Q13761 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RUNX3Q13761 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RUNX3Q13761 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RUNX3Q13761 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUNX3Q13761 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RUNX3Q13761 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUNX3Q13761 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RUNX3Q13761 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RUNX3Q13761 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RUNX3Q13761 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUNX3Q13761 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUNX3Q13761 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUNX3Q13761 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUNX3Q13761 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RUNX3Q13761 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RUNX3Q13761 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RUNX3Q13761 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RUNX3Q13761 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RUNX3Q13761 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RUNX3Q13761 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RUNX3Q13761 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RUNX3Q13761 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RUNX3Q13761 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RUNX3Q13761 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RUNX3Q13761 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RUNX3Q13761 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RUNX3Q13761 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RUNX3Q13761 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RUNX3Q13761 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RUNX3Q13761 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RUNX3Q13761 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RUNX3Q13761 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RUNX3Q13761 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RUNX3Q13761 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RUNX3Q13761 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RUNX3Q13761 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RUNX3Q13761 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RUNX3Q13761 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RUNX3Q13761 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RUNX3Q13761 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RUNX3Q13761 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RUNX3Q13761 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RUNX3Q13761 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RUNX3Q13761 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RUNX3Q13761 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RUNX3Q13761 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RUNX3Q13761 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RUNX3Q13761 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RUNX3Q13761 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RUNX3Q13761 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RUNX3Q13761 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RUNX3Q13761 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RUNX3Q13761 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RUNX3Q13761 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RUNX3Q13761 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RUNX3Q13761 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RUNX3Q13761 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RUNX3Q13761 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RUNX3Q13761 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RUNX3Q13761 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RUNX3Q13761 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RUNX3Q13761 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RUNX3Q13761 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RUNX3Q13761 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RUNX3Q13761 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RUNX3Q13761 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RUNX3Q13761 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RUNX3Q13761 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RUNX3Q13761 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RUNX3Q13761 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RUNX3Q13761 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RUNX3Q13761 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RUNX3Q13761 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RUNX3Q13761 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RUNX3Q13761 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RUNX3Q13761 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RUNX3Q13761 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RUNX3Q13761 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RUNX3Q13761 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RUNX3Q13761 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RUNX3Q13761 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RUNX3Q13761 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RUNX3Q13761 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RUNX3Q13761 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RUNX3Q13761 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RUNX3Q13761 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RUNX3Q13761 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RUNX3Q13761 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RUNX3Q13761 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RUNX3Q13761 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RUNX3Q13761 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RUNX3Q13761 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
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