Protein–RNA interactions for Protein: Q13546

RIPK1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK1Q13546 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIPK1Q13546 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIPK1Q13546 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIPK1Q13546 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIPK1Q13546 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIPK1Q13546 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIPK1Q13546 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIPK1Q13546 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIPK1Q13546 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIPK1Q13546 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIPK1Q13546 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIPK1Q13546 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIPK1Q13546 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIPK1Q13546 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIPK1Q13546 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIPK1Q13546 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIPK1Q13546 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIPK1Q13546 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIPK1Q13546 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIPK1Q13546 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIPK1Q13546 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIPK1Q13546 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIPK1Q13546 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIPK1Q13546 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIPK1Q13546 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIPK1Q13546 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIPK1Q13546 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIPK1Q13546 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIPK1Q13546 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIPK1Q13546 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RIPK1Q13546 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIPK1Q13546 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIPK1Q13546 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RIPK1Q13546 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIPK1Q13546 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIPK1Q13546 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIPK1Q13546 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIPK1Q13546 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIPK1Q13546 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIPK1Q13546 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIPK1Q13546 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIPK1Q13546 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIPK1Q13546 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIPK1Q13546 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIPK1Q13546 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIPK1Q13546 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIPK1Q13546 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIPK1Q13546 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIPK1Q13546 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIPK1Q13546 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIPK1Q13546 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIPK1Q13546 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIPK1Q13546 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIPK1Q13546 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIPK1Q13546 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIPK1Q13546 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIPK1Q13546 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIPK1Q13546 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIPK1Q13546 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIPK1Q13546 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIPK1Q13546 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIPK1Q13546 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIPK1Q13546 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIPK1Q13546 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIPK1Q13546 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIPK1Q13546 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RIPK1Q13546 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RIPK1Q13546 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIPK1Q13546 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIPK1Q13546 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIPK1Q13546 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIPK1Q13546 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIPK1Q13546 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIPK1Q13546 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIPK1Q13546 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIPK1Q13546 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIPK1Q13546 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIPK1Q13546 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RIPK1Q13546 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIPK1Q13546 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIPK1Q13546 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIPK1Q13546 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIPK1Q13546 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIPK1Q13546 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIPK1Q13546 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIPK1Q13546 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIPK1Q13546 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIPK1Q13546 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIPK1Q13546 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIPK1Q13546 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIPK1Q13546 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIPK1Q13546 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RIPK1Q13546 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIPK1Q13546 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIPK1Q13546 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIPK1Q13546 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIPK1Q13546 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIPK1Q13546 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIPK1Q13546 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIPK1Q13546 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
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