Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCGB2A2Q13296 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCGB2A2Q13296 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCGB2A2Q13296 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCGB2A2Q13296 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCGB2A2Q13296 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCGB2A2Q13296 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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SCGB2A2Q13296 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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SCGB2A2Q13296 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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SCGB2A2Q13296 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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SCGB2A2Q13296 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCGB2A2Q13296 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCGB2A2Q13296 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCGB2A2Q13296 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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SCGB2A2Q13296 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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SCGB2A2Q13296 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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SCGB2A2Q13296 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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SCGB2A2Q13296 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCGB2A2Q13296 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCGB2A2Q13296 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
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SCGB2A2Q13296 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCGB2A2Q13296 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
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SCGB2A2Q13296 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCGB2A2Q13296 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCGB2A2Q13296 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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SCGB2A2Q13296 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCGB2A2Q13296 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCGB2A2Q13296 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCGB2A2Q13296 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCGB2A2Q13296 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SCGB2A2Q13296 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SCGB2A2Q13296 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCGB2A2Q13296 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCGB2A2Q13296 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCGB2A2Q13296 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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