Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFF3Q07654 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFF3Q07654 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFF3Q07654 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFF3Q07654 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFF3Q07654 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFF3Q07654 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFF3Q07654 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFF3Q07654 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFF3Q07654 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFF3Q07654 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TFF3Q07654 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TFF3Q07654 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFF3Q07654 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFF3Q07654 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFF3Q07654 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFF3Q07654 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFF3Q07654 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFF3Q07654 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TFF3Q07654 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TFF3Q07654 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TFF3Q07654 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TFF3Q07654 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TFF3Q07654 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TFF3Q07654 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TFF3Q07654 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TFF3Q07654 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TFF3Q07654 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TFF3Q07654 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TFF3Q07654 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
TFF3Q07654 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TFF3Q07654 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TFF3Q07654 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TFF3Q07654 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TFF3Q07654 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TFF3Q07654 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TFF3Q07654 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TFF3Q07654 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TFF3Q07654 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TFF3Q07654 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TFF3Q07654 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TFF3Q07654 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TFF3Q07654 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TFF3Q07654 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TFF3Q07654 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TFF3Q07654 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TFF3Q07654 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TFF3Q07654 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TFF3Q07654 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TFF3Q07654 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TFF3Q07654 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TFF3Q07654 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TFF3Q07654 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TFF3Q07654 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TFF3Q07654 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TFF3Q07654 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TFF3Q07654 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TFF3Q07654 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TFF3Q07654 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TFF3Q07654 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFF3Q07654 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFF3Q07654 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFF3Q07654 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFF3Q07654 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFF3Q07654 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFF3Q07654 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFF3Q07654 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFF3Q07654 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFF3Q07654 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFF3Q07654 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFF3Q07654 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFF3Q07654 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFF3Q07654 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFF3Q07654 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFF3Q07654 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFF3Q07654 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TFF3Q07654 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFF3Q07654 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFF3Q07654 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFF3Q07654 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFF3Q07654 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFF3Q07654 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
TFF3Q07654 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TFF3Q07654 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFF3Q07654 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFF3Q07654 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFF3Q07654 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFF3Q07654 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFF3Q07654 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFF3Q07654 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFF3Q07654 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFF3Q07654 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFF3Q07654 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFF3Q07654 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFF3Q07654 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFF3Q07654 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFF3Q07654 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFF3Q07654 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFF3Q07654 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TFF3Q07654 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1053.9 ms