Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LTBQ06643 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LTBQ06643 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LTBQ06643 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LTBQ06643 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LTBQ06643 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LTBQ06643 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LTBQ06643 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LTBQ06643 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LTBQ06643 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LTBQ06643 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LTBQ06643 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LTBQ06643 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LTBQ06643 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LTBQ06643 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LTBQ06643 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LTBQ06643 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LTBQ06643 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LTBQ06643 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LTBQ06643 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LTBQ06643 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LTBQ06643 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTBQ06643 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTBQ06643 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTBQ06643 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTBQ06643 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTBQ06643 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTBQ06643 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTBQ06643 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTBQ06643 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTBQ06643 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTBQ06643 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBQ06643 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBQ06643 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTBQ06643 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTBQ06643 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTBQ06643 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTBQ06643 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTBQ06643 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTBQ06643 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTBQ06643 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTBQ06643 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LTBQ06643 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LTBQ06643 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LTBQ06643 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LTBQ06643 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LTBQ06643 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LTBQ06643 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LTBQ06643 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LTBQ06643 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LTBQ06643 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LTBQ06643 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LTBQ06643 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LTBQ06643 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LTBQ06643 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LTBQ06643 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LTBQ06643 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LTBQ06643 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LTBQ06643 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LTBQ06643 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LTBQ06643 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LTBQ06643 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LTBQ06643 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LTBQ06643 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LTBQ06643 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LTBQ06643 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LTBQ06643 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LTBQ06643 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LTBQ06643 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LTBQ06643 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LTBQ06643 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LTBQ06643 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTBQ06643 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTBQ06643 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTBQ06643 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LTBQ06643 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTBQ06643 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTBQ06643 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTBQ06643 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTBQ06643 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTBQ06643 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTBQ06643 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBQ06643 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBQ06643 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBQ06643 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBQ06643 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBQ06643 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBQ06643 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBQ06643 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBQ06643 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBQ06643 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBQ06643 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTBQ06643 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTBQ06643 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LTBQ06643 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTBQ06643 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTBQ06643 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LTBQ06643 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTBQ06643 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LTBQ06643 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1197.6 ms