Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DEUP1Q05D60 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DEUP1Q05D60 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DEUP1Q05D60 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DEUP1Q05D60 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DEUP1Q05D60 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DEUP1Q05D60 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DEUP1Q05D60 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DEUP1Q05D60 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
DEUP1Q05D60 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DEUP1Q05D60 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DEUP1Q05D60 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DEUP1Q05D60 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DEUP1Q05D60 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DEUP1Q05D60 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DEUP1Q05D60 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
DEUP1Q05D60 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DEUP1Q05D60 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DEUP1Q05D60 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DEUP1Q05D60 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DEUP1Q05D60 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DEUP1Q05D60 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DEUP1Q05D60 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DEUP1Q05D60 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DEUP1Q05D60 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
DEUP1Q05D60 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DEUP1Q05D60 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DEUP1Q05D60 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DEUP1Q05D60 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DEUP1Q05D60 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DEUP1Q05D60 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DEUP1Q05D60 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DEUP1Q05D60 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DEUP1Q05D60 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DEUP1Q05D60 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DEUP1Q05D60 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DEUP1Q05D60 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DEUP1Q05D60 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DEUP1Q05D60 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DEUP1Q05D60 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DEUP1Q05D60 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DEUP1Q05D60 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DEUP1Q05D60 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DEUP1Q05D60 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
DEUP1Q05D60 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DEUP1Q05D60 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DEUP1Q05D60 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DEUP1Q05D60 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
DEUP1Q05D60 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DEUP1Q05D60 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DEUP1Q05D60 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DEUP1Q05D60 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DEUP1Q05D60 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DEUP1Q05D60 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DEUP1Q05D60 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
DEUP1Q05D60 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DEUP1Q05D60 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DEUP1Q05D60 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DEUP1Q05D60 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DEUP1Q05D60 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DEUP1Q05D60 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DEUP1Q05D60 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DEUP1Q05D60 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DEUP1Q05D60 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DEUP1Q05D60 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DEUP1Q05D60 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DEUP1Q05D60 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DEUP1Q05D60 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DEUP1Q05D60 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DEUP1Q05D60 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DEUP1Q05D60 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DEUP1Q05D60 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DEUP1Q05D60 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DEUP1Q05D60 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DEUP1Q05D60 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DEUP1Q05D60 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DEUP1Q05D60 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DEUP1Q05D60 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DEUP1Q05D60 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DEUP1Q05D60 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DEUP1Q05D60 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
DEUP1Q05D60 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
DEUP1Q05D60 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
DEUP1Q05D60 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DEUP1Q05D60 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DEUP1Q05D60 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DEUP1Q05D60 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DEUP1Q05D60 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DEUP1Q05D60 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DEUP1Q05D60 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DEUP1Q05D60 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DEUP1Q05D60 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
DEUP1Q05D60 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DEUP1Q05D60 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DEUP1Q05D60 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DEUP1Q05D60 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DEUP1Q05D60 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DEUP1Q05D60 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DEUP1Q05D60 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DEUP1Q05D60 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms