Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNP2Q05952 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNP2Q05952 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNP2Q05952 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNP2Q05952 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNP2Q05952 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNP2Q05952 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNP2Q05952 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNP2Q05952 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNP2Q05952 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNP2Q05952 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNP2Q05952 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TNP2Q05952 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNP2Q05952 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNP2Q05952 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNP2Q05952 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNP2Q05952 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNP2Q05952 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNP2Q05952 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNP2Q05952 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNP2Q05952 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNP2Q05952 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNP2Q05952 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNP2Q05952 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNP2Q05952 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNP2Q05952 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNP2Q05952 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNP2Q05952 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNP2Q05952 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TNP2Q05952 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNP2Q05952 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNP2Q05952 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNP2Q05952 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNP2Q05952 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNP2Q05952 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNP2Q05952 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNP2Q05952 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNP2Q05952 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNP2Q05952 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNP2Q05952 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNP2Q05952 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNP2Q05952 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNP2Q05952 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNP2Q05952 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNP2Q05952 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNP2Q05952 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNP2Q05952 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TNP2Q05952 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNP2Q05952 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNP2Q05952 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNP2Q05952 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TNP2Q05952 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNP2Q05952 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNP2Q05952 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNP2Q05952 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNP2Q05952 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNP2Q05952 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNP2Q05952 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNP2Q05952 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TNP2Q05952 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNP2Q05952 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TNP2Q05952 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNP2Q05952 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNP2Q05952 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNP2Q05952 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TNP2Q05952 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNP2Q05952 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNP2Q05952 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNP2Q05952 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TNP2Q05952 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNP2Q05952 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNP2Q05952 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNP2Q05952 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNP2Q05952 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNP2Q05952 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNP2Q05952 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNP2Q05952 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNP2Q05952 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TNP2Q05952 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNP2Q05952 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNP2Q05952 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNP2Q05952 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNP2Q05952 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNP2Q05952 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNP2Q05952 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNP2Q05952 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNP2Q05952 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNP2Q05952 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNP2Q05952 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNP2Q05952 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNP2Q05952 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNP2Q05952 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNP2Q05952 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNP2Q05952 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNP2Q05952 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TNP2Q05952 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNP2Q05952 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNP2Q05952 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNP2Q05952 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TNP2Q05952 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms