Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAV1Q03135 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAV1Q03135 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAV1Q03135 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAV1Q03135 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAV1Q03135 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAV1Q03135 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAV1Q03135 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAV1Q03135 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAV1Q03135 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAV1Q03135 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAV1Q03135 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAV1Q03135 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CAV1Q03135 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CAV1Q03135 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAV1Q03135 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAV1Q03135 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAV1Q03135 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAV1Q03135 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAV1Q03135 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAV1Q03135 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CAV1Q03135 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAV1Q03135 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAV1Q03135 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAV1Q03135 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CAV1Q03135 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAV1Q03135 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAV1Q03135 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAV1Q03135 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAV1Q03135 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAV1Q03135 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CAV1Q03135 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CAV1Q03135 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CAV1Q03135 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAV1Q03135 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAV1Q03135 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAV1Q03135 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAV1Q03135 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAV1Q03135 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAV1Q03135 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAV1Q03135 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAV1Q03135 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAV1Q03135 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAV1Q03135 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAV1Q03135 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAV1Q03135 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAV1Q03135 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAV1Q03135 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAV1Q03135 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CAV1Q03135 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAV1Q03135 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAV1Q03135 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAV1Q03135 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAV1Q03135 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAV1Q03135 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAV1Q03135 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAV1Q03135 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAV1Q03135 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAV1Q03135 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAV1Q03135 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAV1Q03135 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAV1Q03135 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CAV1Q03135 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CAV1Q03135 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAV1Q03135 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAV1Q03135 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAV1Q03135 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAV1Q03135 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAV1Q03135 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAV1Q03135 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAV1Q03135 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAV1Q03135 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAV1Q03135 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAV1Q03135 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAV1Q03135 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAV1Q03135 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAV1Q03135 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAV1Q03135 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAV1Q03135 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAV1Q03135 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAV1Q03135 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAV1Q03135 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAV1Q03135 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAV1Q03135 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAV1Q03135 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAV1Q03135 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAV1Q03135 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAV1Q03135 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAV1Q03135 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAV1Q03135 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAV1Q03135 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CAV1Q03135 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CAV1Q03135 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAV1Q03135 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAV1Q03135 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAV1Q03135 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAV1Q03135 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAV1Q03135 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CAV1Q03135 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAV1Q03135 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms