Protein–RNA interactions for Protein: Q02575

NHLH1, Helix-loop-helix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH1Q02575 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NHLH1Q02575 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NHLH1Q02575 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NHLH1Q02575 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NHLH1Q02575 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NHLH1Q02575 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NHLH1Q02575 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NHLH1Q02575 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NHLH1Q02575 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NHLH1Q02575 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NHLH1Q02575 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NHLH1Q02575 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NHLH1Q02575 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NHLH1Q02575 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NHLH1Q02575 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NHLH1Q02575 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NHLH1Q02575 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NHLH1Q02575 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NHLH1Q02575 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NHLH1Q02575 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NHLH1Q02575 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NHLH1Q02575 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NHLH1Q02575 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NHLH1Q02575 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NHLH1Q02575 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NHLH1Q02575 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NHLH1Q02575 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NHLH1Q02575 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NHLH1Q02575 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NHLH1Q02575 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NHLH1Q02575 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NHLH1Q02575 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NHLH1Q02575 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NHLH1Q02575 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NHLH1Q02575 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NHLH1Q02575 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NHLH1Q02575 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NHLH1Q02575 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NHLH1Q02575 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NHLH1Q02575 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NHLH1Q02575 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NHLH1Q02575 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NHLH1Q02575 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NHLH1Q02575 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NHLH1Q02575 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NHLH1Q02575 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NHLH1Q02575 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NHLH1Q02575 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NHLH1Q02575 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NHLH1Q02575 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NHLH1Q02575 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NHLH1Q02575 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NHLH1Q02575 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NHLH1Q02575 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NHLH1Q02575 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NHLH1Q02575 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NHLH1Q02575 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NHLH1Q02575 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NHLH1Q02575 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NHLH1Q02575 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NHLH1Q02575 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NHLH1Q02575 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NHLH1Q02575 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NHLH1Q02575 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NHLH1Q02575 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NHLH1Q02575 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NHLH1Q02575 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NHLH1Q02575 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NHLH1Q02575 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NHLH1Q02575 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NHLH1Q02575 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NHLH1Q02575 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NHLH1Q02575 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NHLH1Q02575 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NHLH1Q02575 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NHLH1Q02575 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NHLH1Q02575 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NHLH1Q02575 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NHLH1Q02575 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NHLH1Q02575 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NHLH1Q02575 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NHLH1Q02575 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NHLH1Q02575 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NHLH1Q02575 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NHLH1Q02575 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NHLH1Q02575 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NHLH1Q02575 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NHLH1Q02575 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NHLH1Q02575 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NHLH1Q02575 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NHLH1Q02575 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NHLH1Q02575 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NHLH1Q02575 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NHLH1Q02575 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NHLH1Q02575 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NHLH1Q02575 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NHLH1Q02575 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NHLH1Q02575 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NHLH1Q02575 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NHLH1Q02575 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms