Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF17Q02223 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF17Q02223 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF17Q02223 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF17Q02223 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF17Q02223 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF17Q02223 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF17Q02223 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF17Q02223 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF17Q02223 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF17Q02223 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF17Q02223 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF17Q02223 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF17Q02223 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF17Q02223 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF17Q02223 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF17Q02223 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF17Q02223 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF17Q02223 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF17Q02223 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF17Q02223 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF17Q02223 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF17Q02223 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF17Q02223 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF17Q02223 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF17Q02223 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF17Q02223 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF17Q02223 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF17Q02223 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF17Q02223 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF17Q02223 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF17Q02223 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF17Q02223 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF17Q02223 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFRSF17Q02223 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFRSF17Q02223 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFRSF17Q02223 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF17Q02223 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF17Q02223 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF17Q02223 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF17Q02223 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF17Q02223 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF17Q02223 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF17Q02223 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFRSF17Q02223 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFRSF17Q02223 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFRSF17Q02223 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFRSF17Q02223 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFRSF17Q02223 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFRSF17Q02223 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFRSF17Q02223 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFRSF17Q02223 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFRSF17Q02223 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFRSF17Q02223 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFRSF17Q02223 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFRSF17Q02223 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFRSF17Q02223 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFRSF17Q02223 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNFRSF17Q02223 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNFRSF17Q02223 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF17Q02223 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF17Q02223 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF17Q02223 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF17Q02223 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF17Q02223 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF17Q02223 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFRSF17Q02223 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFRSF17Q02223 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFRSF17Q02223 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFRSF17Q02223 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF17Q02223 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF17Q02223 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF17Q02223 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF17Q02223 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFRSF17Q02223 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFRSF17Q02223 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFRSF17Q02223 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFRSF17Q02223 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFRSF17Q02223 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFRSF17Q02223 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFRSF17Q02223 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFRSF17Q02223 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFRSF17Q02223 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFRSF17Q02223 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFRSF17Q02223 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFRSF17Q02223 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFRSF17Q02223 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFRSF17Q02223 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFRSF17Q02223 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFRSF17Q02223 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFRSF17Q02223 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFRSF17Q02223 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFRSF17Q02223 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFRSF17Q02223 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFRSF17Q02223 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFRSF17Q02223 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFRSF17Q02223 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFRSF17Q02223 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFRSF17Q02223 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFRSF17Q02223 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms