Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BNC1Q01954 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BNC1Q01954 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BNC1Q01954 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BNC1Q01954 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BNC1Q01954 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BNC1Q01954 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BNC1Q01954 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BNC1Q01954 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BNC1Q01954 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BNC1Q01954 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BNC1Q01954 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BNC1Q01954 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BNC1Q01954 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BNC1Q01954 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BNC1Q01954 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BNC1Q01954 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BNC1Q01954 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BNC1Q01954 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
BNC1Q01954 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BNC1Q01954 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BNC1Q01954 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BNC1Q01954 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BNC1Q01954 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BNC1Q01954 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BNC1Q01954 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
BNC1Q01954 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BNC1Q01954 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BNC1Q01954 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BNC1Q01954 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
BNC1Q01954 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BNC1Q01954 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BNC1Q01954 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BNC1Q01954 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BNC1Q01954 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BNC1Q01954 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BNC1Q01954 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BNC1Q01954 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BNC1Q01954 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BNC1Q01954 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
BNC1Q01954 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BNC1Q01954 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BNC1Q01954 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BNC1Q01954 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
BNC1Q01954 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BNC1Q01954 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BNC1Q01954 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BNC1Q01954 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
BNC1Q01954 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BNC1Q01954 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BNC1Q01954 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BNC1Q01954 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BNC1Q01954 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BNC1Q01954 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BNC1Q01954 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BNC1Q01954 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BNC1Q01954 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BNC1Q01954 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BNC1Q01954 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BNC1Q01954 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BNC1Q01954 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BNC1Q01954 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BNC1Q01954 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BNC1Q01954 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BNC1Q01954 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BNC1Q01954 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BNC1Q01954 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BNC1Q01954 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BNC1Q01954 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BNC1Q01954 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BNC1Q01954 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BNC1Q01954 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BNC1Q01954 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BNC1Q01954 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BNC1Q01954 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BNC1Q01954 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BNC1Q01954 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BNC1Q01954 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BNC1Q01954 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BNC1Q01954 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BNC1Q01954 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BNC1Q01954 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BNC1Q01954 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BNC1Q01954 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BNC1Q01954 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BNC1Q01954 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BNC1Q01954 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BNC1Q01954 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BNC1Q01954 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
BNC1Q01954 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BNC1Q01954 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
BNC1Q01954 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BNC1Q01954 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BNC1Q01954 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BNC1Q01954 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BNC1Q01954 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BNC1Q01954 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BNC1Q01954 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BNC1Q01954 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BNC1Q01954 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms