Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA1DQ01668 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA1DQ01668 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA1DQ01668 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA1DQ01668 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1DQ01668 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1DQ01668 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1DQ01668 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1DQ01668 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1DQ01668 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1DQ01668 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1DQ01668 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1DQ01668 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1DQ01668 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1DQ01668 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1DQ01668 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1DQ01668 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1DQ01668 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1DQ01668 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1DQ01668 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1DQ01668 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1DQ01668 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1DQ01668 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1DQ01668 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1DQ01668 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1DQ01668 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1DQ01668 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA1DQ01668 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA1DQ01668 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA1DQ01668 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA1DQ01668 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA1DQ01668 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA1DQ01668 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1DQ01668 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1DQ01668 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1DQ01668 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1DQ01668 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA1DQ01668 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA1DQ01668 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA1DQ01668 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA1DQ01668 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA1DQ01668 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA1DQ01668 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA1DQ01668 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA1DQ01668 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1DQ01668 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1DQ01668 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1DQ01668 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1DQ01668 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1DQ01668 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA1DQ01668 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA1DQ01668 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA1DQ01668 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1DQ01668 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1DQ01668 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1DQ01668 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1DQ01668 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1DQ01668 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA1DQ01668 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA1DQ01668 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA1DQ01668 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA1DQ01668 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA1DQ01668 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA1DQ01668 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA1DQ01668 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA1DQ01668 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA1DQ01668 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA1DQ01668 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA1DQ01668 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA1DQ01668 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA1DQ01668 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA1DQ01668 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA1DQ01668 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA1DQ01668 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA1DQ01668 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA1DQ01668 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA1DQ01668 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA1DQ01668 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA1DQ01668 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA1DQ01668 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA1DQ01668 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA1DQ01668 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA1DQ01668 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA1DQ01668 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA1DQ01668 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA1DQ01668 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA1DQ01668 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CACNA1DQ01668 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA1DQ01668 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA1DQ01668 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1DQ01668 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1DQ01668 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1DQ01668 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA1DQ01668 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA1DQ01668 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA1DQ01668 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1DQ01668 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1DQ01668 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1DQ01668 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA1DQ01668 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms